Gen
GRXCR1
glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1
- HGNC 31673↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000215203↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 389207↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 4p13
- Współrzędne
- Chromosom 4: 42 892 713–43 030 658 (GRCh38)
- Eksony
- 4 eksonów na odcinku 137,9 kb
- Białko
- 290 aminokwasów
- Znany również jako
- PPP1R88
- Poprzednie symbole
- DFNB25
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000399770.3NM_001080476.3
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/grxcr1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj GRXCR1 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Utrata słuchu i głuchota
- Niezespołowa genetyczna utrata słuchu
Jeden z 97 powiązanych z nim genów
Dziedziczna utrata słuchu bez innych objawów medycznych, obejmująca częste recesywne postacie wywoływane przez GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC i wiele innych genów, a także postacie dominujące, sprzężone z chromosomem X oraz mitochondrialne.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 4 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Znajomość genetycznej przyczyny może pomóc w wyborze wsparcia słuchowego i decyzji dotyczących implantu ślimakowego, kwalifikacji do badań terapii genowych (na przykład w przypadku OTOF) oraz poradnictwa rodzinnego.
Budowa genu GRXCR1
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 1,5 kb z 137,9 kb genu; 873 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie GRXCR1
2Niski
Jak trudno sekwencjonować GRXCR1 krótkimi odczytami, w skali 0–100Każdy słupek to udział zasad eksonowych GRXCR1 w danym rodzaju trudnego regionu. Wynik waży je zgodnie z tym, ile każda z nich kosztuje w wywołaniu wariantów z krótkich odczytów: 0, gdy żadna zasada nie znajduje się w takim regionie, 100, gdy każda zasada znajduje się we wszystkich takich regionach.
- MapowalnośćFragmenty, w których odczytów o długości 100 lub 250 pz nie da się jednoznacznie umieścić, więc wywołanie wariantu w tych miejscach może być brakujące lub błędne. Waga 35%.0%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych miejscach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub więcej. Waga 30%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednego zasadu, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować. Waga 15%.5,5%
- Zawartość GCOkna o zawartości G i C poniżej 25% lub powyżej 65%, które słabo pokrywa przygotowanie biblioteki. Waga 10%.9,1%
- Pokrycie referencyjneLuki w pobliskim składzie referencyjnym, w których nie ma sekwencji, do której mogłyby się dopasować odczyty. Waga 10%.0%
10
pozycje w GRXCR1, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadna z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odnajdują.
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 137,9 kb GRXCR1, łącznie z intronami, a nie tylko 1,5 kb eksonów.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- ACTG1actin gamma 1Wspólne schorzenie: 1
- AFG2BAAA ATPase AFG2BWspólne schorzenie: 1
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Wspólne schorzenie: 1
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11AWspólne schorzenie: 1
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2Wspólne schorzenie: 1
- CABP2calcium binding protein 2Wspólne schorzenie: 1
- CD164CD164 moleculeWspólne schorzenie: 1
- CDC14Acell division cycle 14AWspólne schorzenie: 1
- CDH23cadherin related 23Wspólne schorzenie: 1
- CEACAM16CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane componentWspólne schorzenie: 1
- CIB2calcium and integrin binding family member 2Wspólne schorzenie: 1
- CLDN14claudin 14Wspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem GRXCR1
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać GRXCR1. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-17: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.17-8666dff2.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen GRXCR1: glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/grxcr1
Dante Labs. Gen GRXCR1: glutaredoxin and cysteine rich domain containing 1 [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/grxcr1
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni