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Gene

TCF20

transcription factor 20

Sintesi

Localizzazione citogenetica
22q13.2
Coordinate
Cromosoma 22: 42.160.013–42.270.653 (GRCh38)
Esoni
6 esoni su 110,6 kb
Proteina
1960 amminoacidi
Noto anche come
AR1, SPBP
Trascritto MANE Select
ENST00000677622.1NM_001378418.1
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora TCF20. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di TCF20

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 22, con una parentesi dove si trova TCF20. TCF20 e 24 geni nelle vicinanze sul cromosoma 22, da 41.715.333 a 42.715.332.Cromosoma 2222q13.2p13p12p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.31q13.32q13.3341,8 Mb42 Mb42,2 Mb42,4 Mb42,6 MbMEI1: 41.699.494–41.799.456, filamento direttoMEI1CCDC134: 41.800.321–41.832.178, filamento direttoCCDC134SREBF2: 41.833.029–41.907.308, filamento direttoSREBF2SHISA8: 41.906.316–41.915.129, filamento inversoSHISA8TNFRSF13C: 41.922.032–41.926.806, filamento inversoTNFRSF13CCENPM: 41.927.514–41.947.183, filamento inversoCENPMSMIM45: 41.947.178–41.958.942, filamento direttoSMIM45SEPTIN3: 41.969.443–41.998.221, filamento direttoSEPTIN3WBP2NL: 41.998.725–42.058.456, filamento direttoNAGA: 42.032.595–42.071.198, filamento inversoNAGAPHETA2: 42.073.789–42.079.439, filamento direttoPHETA2SMDT1: 42.079.564–42.090.033, filamento direttoSMDT1NDUFA6: 42.080.336–42.090.884, filamento inversoNDUFA6CYP2D6: 42.120.962–42.131.727, filamento inversoCYP2D6CYP2D7: 42.140.203–42.149.500, filamento inversoCYP2D7TCF20: 42.160.013–42.270.653, filamento inversoTCF20NFAM1: 42.380.407–42.432.425, filamento inversoNFAM1RRP7A: 42.507.982–42.519.853, filamento inversoRRP7ASERHL2: 42.553.617–42.574.387, filamento direttoSERHL2POLDIP3: 42.582.750–42.614.962, filamento inversoPOLDIP3: 42.583.836–42.627.688, filamento inversoRNU12: 42.615.244–42.615.393, filamento direttoRNU12CYB5R3: 42.615.730–42.720.870, filamento inversoATP5MGL: 42.639.803–42.640.601, filamento inversoATP5MGLA4GALT: 42.691.010–42.721.298, filamento inversoA4GALTDiagramma di TCF20: 6 esoni sul filamento inverso del cromosoma 22Esone 3: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 2: 68 siti noti causativi di malattiaEsone 6: 42.160.013–42.161.358, 1346 basiEsone 5: 42.168.609–42.168.736, 128 basiEsone 4: 42.169.847–42.169.896, 50 basiEsone 3: 42.179.609–42.179.702, 94 basiEsone 2: 42.209.651–42.215.341, 5691 basiEsone 1: 42.270.339–42.270.653, 315 basi64215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 7,6 kb dei 110,6 kb del gene; 5883 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge TCF20

69

posizioni in TCF20 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 110,6 kb di TCF20, introni inclusi, non solo i 7,6 kb di esoni.

Tratti collegati a TCF20

L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che TCF20 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene TCF20: transcription factor 20. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/tcf20

Vancouver

Dante Labs. Gene TCF20: transcription factor 20 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/tcf20

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