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Gene

MPDZ

multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component

Sintesi

Localizzazione citogenetica
9p23
Coordinate
Cromosoma 9: 13.105.707–13.279.692 (GRCh38)
Esoni
47 esoni su 174 kb
Proteina
2070 amminoacidi
Noto anche come
MUPP1
Trascritto MANE Select
ENST00000319217.12NM_001378778.1
Tipo di locus
Protein-coding
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora MPDZ. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di MPDZ

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 9, con una parentesi dove si trova MPDZ. MPDZ e 2 geni nelle vicinanze sul cromosoma 9, da 12.692.700 a 13.692.699.Cromosoma 99p23p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.312,8 Mb13 Mb13,2 Mb13,4 Mb13,6 MbTYRP1: 12.333.995–12.710.597, filamento direttoTYRP1LURAP1L: 12.775.005–12.823.060, filamento direttoLURAP1LMPDZ: 13.105.707–13.279.692, filamento inversoMPDZDiagramma di MPDZ: 47 esoni sul filamento inverso del cromosoma 9Esone 45: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 39: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 36: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 35: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 33: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 32: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 29: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 28: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 27: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 25: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 24: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 22: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 20: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 19: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 15: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 14: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 11: 3 siti noti causativi di malattiaEsone 9: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 7: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 6: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 5: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 47: 13.105.707–13.107.111, 1405 basiEsone 46: 13.108.936–13.109.059, 124 basiEsone 45: 13.109.952–13.110.064, 113 basiEsone 44: 13.110.636–13.110.740, 105 basiEsone 43: 13.112.024–13.112.146, 123 basiEsone 42: 13.113.011–13.113.054, 44 basiEsone 41: 13.113.931–13.114.021, 91 basiEsone 40: 13.115.248–13.115.334, 87 basiEsone 39: 13.119.502–13.119.649, 148 basiEsone 38: 13.121.739–13.121.932, 194 basiEsone 37: 13.122.087–13.122.170, 84 basiEsone 36: 13.123.153–13.123.298, 146 basiEsone 35: 13.125.216–13.125.390, 175 basiEsone 34: 13.126.516–13.126.590, 75 basiEsone 33: 13.126.680–13.126.772, 93 basiEsone 32: 13.133.824–13.133.904, 81 basiEsone 31: 13.136.092–13.136.182, 91 basiEsone 30: 13.136.712–13.136.803, 92 basiEsone 29: 13.137.957–13.138.153, 197 basiEsone 28: 13.139.987–13.140.149, 163 basiEsone 27: 13.143.466–13.143.564, 99 basiEsone 26: 13.147.548–13.147.658, 111 basiEsone 25: 13.150.511–13.150.688, 178 basiEsone 24: 13.158.018–13.158.110, 93 basiEsone 23: 13.162.691–13.162.795, 105 basiEsone 22: 13.168.366–13.168.564, 199 basiEsone 21: 13.175.752–13.175.875, 124 basiEsone 20: 13.176.136–13.176.417, 282 basiEsone 19: 13.183.418–13.183.585, 168 basiEsone 18: 13.186.270–13.186.386, 117 basiEsone 17: 13.188.784–13.188.993, 210 basiEsone 16: 13.190.114–13.190.299, 186 basiEsone 15: 13.192.131–13.192.295, 165 basiEsone 14: 13.193.167–13.193.313, 147 basiEsone 13: 13.196.121–13.196.230, 110 basiEsone 12: 13.205.036–13.205.107, 72 basiEsone 11: 13.205.916–13.206.099, 184 basiEsone 10: 13.216.774–13.216.862, 89 basiEsone 9: 13.217.180–13.217.294, 115 basiEsone 8: 13.219.559–13.219.768, 210 basiEsone 7: 13.221.372–13.221.500, 129 basiEsone 6: 13.222.233–13.222.446, 214 basiEsone 5: 13.223.571–13.223.710, 140 basiEsone 4: 13.224.374–13.224.583, 210 basiEsone 3: 13.247.635–13.247.801, 167 basiEsone 2: 13.250.300–13.250.372, 73 basiEsone 1: 13.279.400–13.279.692, 293 basi474030201015′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 7,8 kb dei 174 kb del gene; 6213 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di MPDZ

39

posizioni in MPDZ in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di queste ricade in una regione che le letture corte faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 174 kb di MPDZ, introni compresi, non solo i 7,8 kb di esoni.

Tratti collegati a MPDZ

L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che MPDZ può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.17-8666dff2.

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Dante Labs. (s.d.). Gene MPDZ: multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/mpdz

Vancouver

Dante Labs. Gene MPDZ: multiple PDZ domain crumbs cell polarity complex component [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/mpdz

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