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Gène

SCUBE3

signal peptide, CUB domain and EGF like domain containing 3

Résumé

Localisation cytogénétique
6p21.3
Coordonnées
Chromosome 6 : 35 213 956–35 253 079 (GRCh38)
Exons
22 exons sur 39,1 kb
Protéine
993 acides aminés
Aussi appelé
FLJ34743
Symboles précédents
CEGF3
Transcrit MANE Select
ENST00000274938.8NM_152753.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SCUBE3. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SCUBE3

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 6, avec un crochet à l'emplacement de SCUBE3. SCUBE3 et 13 gènes à proximité sur le chromosome 6, de 34 733 518 à 35 733 517.Chromosome 66p21.3p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2734,8 Mb35 Mb35,2 Mb35,4 Mb35,6 MbSNRPC : 34 757 097–34 774 045, brin directSNRPCBLTP3A : 34 792 024–34 885 350, brin directBLTP3ATAF11 : 34 829 083–34 889 192, brin inverseTAF11ANKS1A : 34 889 243–35 091 421, brin directANKS1ATCP11 : 35 118 071–35 148 610, brin inverseTCP11SCUBE3 : 35 213 956–35 253 079, brin directSCUBE3ZNF76 : 35 258 909–35 295 985, brin directZNF76DEF6 : 35 297 818–35 321 909, brin directDEF6PPARD : 35 342 530–35 428 193, brin directPPARDFANCE : 35 452 315–35 467 106, brin directFANCERPL10A : 35 468 366–35 470 786, brin directRPL10ATEAD3 : 35 473 597–35 497 868, brin inverseTEAD3TULP1 : 35 497 874–35 512 941, brin inverseTULP1FKBP5 : 35 572 945–35 728 622, brin inverseFKBP5Schéma de SCUBE3 : 22 exons sur le brin direct du chromosome 6Exon 3 : 1 site connu associé à une maladieExon 16 : 1 site connu associé à une maladieExon 19 : 2 sites connus associés à une maladieExon 1 : 35 213 956–35 214 503, 548 basesExon 2 : 35 227 580–35 227 702, 123 basesExon 3 : 35 228 614–35 228 739, 126 basesExon 4 : 35 231 725–35 231 859, 135 basesExon 5 : 35 232 850–35 232 975, 126 basesExon 6 : 35 233 185–35 233 301, 117 basesExon 7 : 35 237 902–35 238 018, 117 basesExon 8 : 35 239 752–35 239 874, 123 basesExon 9 : 35 240 374–35 240 490, 117 basesExon 10 : 35 241 141–35 241 266, 126 basesExon 11 : 35 241 543–35 241 659, 117 basesExon 12 : 35 241 806–35 241 910, 105 basesExon 13 : 35 242 204–35 242 320, 117 basesExon 14 : 35 242 622–35 242 780, 159 basesExon 15 : 35 243 021–35 243 236, 216 basesExon 16 : 35 243 594–35 243 755, 162 basesExon 17 : 35 243 963–35 244 130, 168 basesExon 18 : 35 244 650–35 244 811, 162 basesExon 19 : 35 245 228–35 245 425, 198 basesExon 20 : 35 245 944–35 246 096, 153 basesExon 21 : 35 246 206–35 246 285, 80 basesExon 22 : 35 248 556–35 253 079, 4 524 bases15101520225′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 7,8 kb sur les 39,1 kb du gène ; 2 982 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit SCUBE3

5

positions dans SCUBE3 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 39,1 kb de SCUBE3, introns compris, et pas seulement les 7,8 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SCUBE3 : signal peptide, CUB domain and EGF like domain containing 3. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/scube3

Vancouver

Dante Labs. Gène SCUBE3 : signal peptide, CUB domain and EGF like domain containing 3 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/scube3

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