Gen
SOCS1
suppressor of cytokine signaling 1
- HGNC 19383(öffnet sich in einem neuen Tab)
- Ensembl-Gen ENSG00000185338(öffnet sich in einem neuen Tab)
- NCBI Gene 8651(öffnet sich in einem neuen Tab)
Zusammenfassung
- Zytogenetische Lage
- 16p13.13
- Koordinaten
- Chromosom 16: 11.254.417–11.256.204 (GRCh38)
- Exons
- 2 Exons über 1,8 kb
- Protein
- 211 Aminosäuren
- Vererbung
- Autosomal-dominant
- Auch bekannt als
- SOCS-1, SSI-1, JAB, TIP3, Cish1
- MANE-Select-Transkript
- ENST00000332029.4NM_003745.2
- Locus-Typ
- gene with protein product
- Sehr hoch
- Zuversichtlich
- Niedrig
- Sehr niedrig
ReferenzgenomGRCh38hg38
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Seltene monogene autoinflammatorische Erkrankungen
- SOCS1-HaploinsuffizienzAutosomal-dominant
Autoimmunität und Entzündung mit frühem Beginn, etwa Lupus, niedrige Thrombozytenzahl und Arthritis, verursacht durch Varianten in SOCS1.
- ClinGen stuft die Verbindung als eindeutig ein
- 3 GenCC-Einreicher bewerten ihn als eindeutig oder stark
Vererbung
- Autosomal-dominant
- Eine veränderte Kopie von einem der beiden Elternteile reicht aus. Ein Elternteil, das eine solche Kopie hat, gibt sie mit einer Wahrscheinlichkeit von eins zu zwei an jedes Kind weiter.
Aufbau von SOCS1
- Kodierende Sequenz
- Nicht translatierte Region
- Intron
- Transkriptionsrichtung
- Bekannte krankheitsverursachende Stellen
Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.
Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).
Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.
Exons machen 1,2 kb der 1,8 kb des Gens aus; 636 dieser Basen kodieren für das Protein.
So liest ein Gentest SOCS1
4
Positionen in SOCS1, an denen ClinVar eine Veränderung als pathogen oder wahrscheinlich pathogen einstuft
Keine davon liegt in einem Bereich, den Short Reads schwer erfassen.
Ein Ganzgenom-Test erfasst alle 1,8 kb von SOCS1, einschließlich der Introns, und nicht nur die 1,2 kb Exons.
Mit SOCS1 verknüpfte Merkmale
Die Human Phenotype Ontology führt diese als Merkmale der seltenen Erkrankungen auf, die SOCS1 verursachen kann. Auf der Seite jedes Merkmals sind die anderen Gene aufgeführt, die damit in Verbindung stehen.
Externe Links
Gendatensätze
Transkript
Protein
Woher diese Angaben stammen
- HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
- MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
- GenCC und ClinGen, veröffentlicht 2026-10-16: welche Erkrankungen mit dem Gen in Verbindung stehen und wie stark dieser Zusammenhang ist.
- Die ACMG-Liste sekundärer Befunde, SF v3.2.
- ClinVar und die GIAB-Stratifizierungen: bekannte krankheitsverursachende Stellen sowie Regionen, die Kurzlesesequenzierung schwer erfassen kann.
- Human Phenotype Ontology, Version 2026-09-01: die mit dem Gen verknüpften Merkmale. Weitere Informationen unter hpo.jax.org.
- Datenversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Diese Seite zitieren
Dante Labs. (o. J.). SOCS1-Gen: suppressor of cytokine signaling 1. Abgerufen am 17. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/socs1
Dante Labs. SOCS1-Gen: suppressor of cytokine signaling 1 [Internet]. [zitiert am 17. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/socs1
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