Gen
PLCZ1
phospholipase C zeta 1
- HGNC 19218↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000139151↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 89869↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 12p12.3
- Koordinater
- Kromosom 12: 18.683.180–18.738.012 (GRCh38)
- Exoner
- 15 exoner fordelt over 54,8 kb
- Protein
- 608 aminosyrer
- Også kendt som
- NYD-SP27, PLCzeta, Czeta
- MANE Select-transkript
- ENST00000266505.12NM_033123.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/plcz1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs PLCZ1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurateret rapport relevant for dette gen
Mandlig infertilitet
Manglende evne hos manden til at befrugte en ægcelle efter en fastsat periode med ubeskyttet samleje. Mandlig sterilitet er permanent infertilitet.
- 1 GenCC-indsender vurderer den som definitiv eller stærk
Sådan er PLCZ1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 2,1 kb af genets 54,8 kb; 1.827 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af PLCZ1
1Lav
Hvor svært PLCZ1 er at sekventere med korte læsninger, på en skala fra 0 til 100Hver søjle viser andelen af PLCZ1s exonbaser i den pågældende type vanskeligt område. Scoren vægter dem efter, hvor meget hver enkelt koster et kald baseret på korte læsninger: 0, når ingen base ligger i nogen, og 100, når hver base ligger i alle af dem.
- MappabilitetStrækninger, hvor læsninger på 100 eller 250 bp ikke kan placeres entydigt, så et kald dér kan mangle eller være forkert. Vægt 35 %.0 %
- HomologiSegmentale duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Vægt 30 %.0 %
- GentagelserTandemgentagelser og serier af én base, som læsninger glider på, og som muligvis ikke kan spændes over. Vægt 15 %.0,9 %
- GC-indholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker dårligt. Vægt 10 %.11 %
- ReferencedækningHuller i referencesamlingen i nærheden, hvor der ikke findes nogen sekvens, som læsningerne kan justeres mod. Vægt 10 %.0 %
4
positioner i PLCZ1, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i et område, som korte læsninger har svært ved at læse.
En helgenomsekventering dækker alle 54,8 kb af PLCZ1, inklusive introner, ikke kun de 2,1 kb af exoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- ACTL9actin like 9Deler 1 sygdom
- ARMC2armadillo repeat containing 2Deler 1 sygdom
- AURKCaurora kinase CDeler 1 sygdom
- BCORL1BCL6 corepressor like 1Deler 1 sygdom
- CFAP251cilia and flagella associated protein 251Deler 1 sygdom
- CFAP43cilia and flagella associated protein 43Deler 1 sygdom
- DMC1DNA meiotic recombinase 1Deler 1 sygdom
- DMRT1doublesex and mab-3 related transcription factor 1Deler 1 sygdom
- DNAH1dynein axonemal heavy chain 1Deler 1 sygdom
- DNAH10dynein axonemal heavy chain 10Deler 1 sygdom
- DNAH12dynein axonemal heavy chain 12Deler 1 sygdom
- DNAH17dynein axonemal heavy chain 17Deler 1 sygdom
Træk knyttet til PLCZ1
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, PLCZ1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-17: hvilke tilstande genet er forbundet med, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende steder og de regioner, som korte læsninger har svært ved.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.17-8666dff2.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). PLCZ1-genet: phospholipase C zeta 1. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/plcz1
Dante Labs. PLCZ1-genet: phospholipase C zeta 1 [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/plcz1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger