Gen
CLCN6
Cl-/H+ antiporter 6
- HGNC 2024↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000011021↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 1185↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 1p36.22
- Koordinater
- Kromosom 1: 11.806.191–11.843.130 (GRCh38)
- Exoner
- 23 exoner fordelt over 36,9 kb
- Protein
- 869 aminosyrer
- Også kendt som
- CLC-6, KIAA0046, ClC-6
- MANE Select-transkript
- ENST00000346436.11NM_001286.5
- Lokustype
- Protein-coding
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/clcn6.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs CLCN6 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Neuronal ceroid-lipofuscinose
- Autosomal recessiv
En gruppe arvelige, progressive degenerative hjernesygdomme, der klinisk kendetegnes ved tab af mentale og andre evner, epilepsi og synstab på grund af retinal degeneration, og histopatologisk ved intracellulær ophobning af det autofluorescerende materiale ceroid-lipofuscin i nerveceller i hjernen og i nethinden.
- ClinGen vurderer forbindelsen som moderat
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Bredere grupperinger
Lysosomal lagringssygdom
- Lysosomal lagringssygdom (andre og ikke-specificerede typer)
Et af 59 gener, der er knyttet til det
Dækker lysosomale lagringssygdomme uden særskilt rapport, såsom Farbers sygdom og andre ASAH1-relaterede lidelser, mangel på prosaposin (PSAP), multipel sulfatasemangel, mucopolysaccharidose type IX og X samt Dorfman-Chanarins sygdom; arvegangen varierer efter undertype, oftest autosomal recessiv.
- ClinGen vurderer forbindelsen som moderat
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Sådan er CLCN6 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 5,6 kb af genets 36,9 kb; 2.610 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af CLCN6
1
position i CLCN6, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved at dække.
En helgenomsanalyse dækker alle 36,9 kb af CLCN6, inklusive introner, og ikke kun de 5,6 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninDeler 2 sygdomme
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthaseDeler 2 sygdomme
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinDeler 2 sygdomme
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC proteinDeler 2 sygdomme
- CTSDcathepsin DDeler 2 sygdomme
- CTSFcathepsin FDeler 2 sygdomme
- DNAJC5DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C5Deler 2 sygdomme
- GRNgranulin precursorDeler 2 sygdomme
- KCTD7potassium channel tetramerization domain containing 7Deler 2 sygdomme
- MFSD8major facilitator superfamily domain containing 8Deler 2 sygdomme
- PPT1palmitoyl-protein thioesterase 1Deler 2 sygdomme
- TPP1tripeptidyl peptidase 1Deler 2 sygdomme
Træk knyttet til CLCN6
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, CLCN6 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-17: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.17-8666dff2.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). CLCN6-genet: Cl-/H+ antiporter 6. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/clcn6
Dante Labs. CLCN6-genet: Cl-/H+ antiporter 6 [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/clcn6
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger