Gen
ZP1
zona pellucida glycoprotein 1
- HGNC 13187↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000149506↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 22917↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 11q12.2
- Koordinater
- Kromosom 11: 60 867 542–60 875 687 (GRCh38)
- Exoner
- 12 exoner på 8,1 kb
- Protein
- 638 aminosyror
- Även känd som
- ZPB1
- MANE Select-transkript
- ENST00000278853.10NM_207341.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/zp1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs ZP1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Kvinnlig infertilitet
- ärftlig defekt i oocytmognaden
- 2 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Nedsatt eller frånvarande förmåga hos en kvinna att bli gravid.
- 2 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Så är ZP1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 2 kb av genens 8,1 kb, och 1 917 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av ZP1
5Lätt
Hur svår ZP1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Nästan alla exoner i ZP1 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.
Det som adderar: andelen av ZP1:s exoner i varje typ av svårt område
- MappbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 100 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 60 %.0 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Vikt 60 %.0 %
- ReferenstäckningLuckor i referensassemblyn i närheten, där det inte finns någon sekvens för läsningar att anpassas mot. Vikt 50 %.0 %
- RepetitionerTandemrepetitioner och serier av en och samma bas, som läsningar glider på och som kanske inte spänner över. Vikt 30 %.2,5 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker tunnt. Vikt 20 %.19 %
En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängenVarje stapel är andelen av ZP1:s exonbaser i just den typen av svårt område. Varje typ kan i sig göra en gen svår, och varje ytterligare typ adderar mindre: 0 när ingen bas ligger i någon, 100 när varje bas ligger där läsningar inte kan placeras entydigt.
14
positioner i ZP1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller trolig patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsekvensering täcker alla 8,1 kb av ZP1, inklusive introner, inte bara de 2 kb exoner.
ClinVar pathogenic variants (14)
The ZP1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 9
- Patogen/sannolikt patogen 1
- Sannolikt patogen 4
| Variant | Conditions | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_207341.4(ZP1):c.1113-2A>G (opens in a new tab) | female infertility due to zona pellucida defect | Patogen/sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_207341.4(ZP1):c.199G>T (p.Glu67Ter) (opens in a new tab) | female infertility due to zona pellucida defect | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_207341.4(ZP1):c.670C>T (p.Arg224Ter) (opens in a new tab) | female infertility due to zona pellucida defect | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_207341.4(ZP1):c.769C>T (p.Gln257Ter) (opens in a new tab) | female infertility due to zona pellucida defect and 1 other | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_207341.4(ZP1):c.874C>T (p.Gln292Ter) (opens in a new tab) | female infertility due to zona pellucida defect | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_207341.4(ZP1):c.1129_1130del (p.Val377fs) (opens in a new tab) | female infertility due to zona pellucida defect | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_207341.4(ZP1):c.1169_1176del (p.Ile390fs) (opens in a new tab) | female infertility due to zona pellucida defect | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_207341.4(ZP1):c.1168del (p.Ile390fs) (opens in a new tab) | female infertility due to zona pellucida defect | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_207341.4(ZP1):c.1602C>A (p.Cys534Ter) (opens in a new tab) | female infertility due to zona pellucida defect | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_207341.4(ZP1):c.1708G>A (p.Val570Met) (opens in a new tab) | female infertility due to zona pellucida defect | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_207341.4(ZP1):c.217_221del (p.Asp73fs) (opens in a new tab) | female infertility due to zona pellucida defect | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_207341.4(ZP1):c.318+2T>C (opens in a new tab) | female infertility due to zona pellucida defect | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_207341.4(ZP1):c.1499C>A (p.Ser500Ter) (opens in a new tab) | female infertility due to zona pellucida defect | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_207341.4(ZP1):c.1660C>T (p.Arg554Ter) (opens in a new tab) | female infertility due to zona pellucida defect | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
Gener kopplade till samma tillstånd
- ANKRD31ankyrin repeat domain 31Delar 1 tillstånd
- ATMATM serine/threonine kinaseDelar 1 tillstånd
- BMP15bone morphogenetic protein 15Delar 1 tillstånd
- BNC1basonuclin zinc finger protein 1Delar 1 tillstånd
- BTG4BTG anti-proliferation factor 4Delar 1 tillstånd
- CDC20cell division cycle 20Delar 1 tillstånd
- CLPPcaseinolytic mitochondrial matrix peptidase proteolytic subunitDelar 1 tillstånd
- CYP19A1cytochrome P450 family 19 subfamily A member 1Delar 1 tillstånd
- FANCMFA complementation group MDelar 1 tillstånd
- FIGLAfolliculogenesis specific bHLH transcription factorDelar 1 tillstånd
- FMR1fragile X messenger ribonucleoprotein 1Delar 1 tillstånd
- FOXL2forkhead box L2Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till ZP1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som ZP1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-19: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.19-9814e911.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). ZP1-genen: zona pellucida glycoprotein 1. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/zp1
Dante Labs. ZP1-genen: zona pellucida glycoprotein 1 [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/zp1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor