Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

SMG9

SMG9 nonsense mediated mRNA decay factor

Sammanfattning

Cytogenetisk position
19q13.31
Koordinater
Kromosom 19: 43 727 983–43 754 962 (GRCh38)
Exoner
14 exoner på 27 kb
Protein
520 aminosyror
Även känd som
FLJ12886
Tidigare symboler
C19orf61
MANE Select-transkript
ENST00000270066.11NM_019108.4
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser SMG9 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är SMG9 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Kända sjukdomsorsakande ställen
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 19, med en parentes där SMG9 finns. SMG9 och 35 gener i närheten på kromosom 19, från 43 241 473 till 44 241 472.Kromosom 1919q13.31p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4343,4 Mb43,6 Mb43,8 Mb44 Mb44,2 MbPSG9: 43 211 791–43 269 563, bakåt-strängPSG9CD177: 43 353 686–43 364 397, framåt-strängCD177TEX101: 43 401 496–43 418 613, framåt-strängTEX101LYPD3: 43 460 787–43 465 608, bakåt-strängLYPD3PHLDB3: 43 473 625–43 505 301, bakåt-strängPHLDB3ETHE1: 43 506 713–43 527 259, bakåt-strängETHE1ZNF575: 43 525 497–43 541 813, framåt-strängZNF575XRCC1: 43 543 306–43 580 473, bakåt-sträng: 43 554 692–43 593 036, bakåt-strängPINLYP: 43 575 801–43 583 964, framåt-strängIRGQ: 43 584 367–43 596 150, bakåt-strängZNF576: 43 593 805–43 601 189, framåt-strängZNF576SRRM5: 43 596 617–43 614 498, framåt-strängSRRM5ZNF428: 43 607 223–43 619 914, bakåt-strängZNF428CADM4: 43 622 055–43 639 858, bakåt-strängCADM4PLAUR: 43 645 672–43 670 547, bakåt-strängPLAURIRGC: 43 716 076–43 720 021, framåt-strängIRGCSMG9: 43 727 983–43 754 962, bakåt-strängSMG9KCNN4: 43 766 517–43 781 262, bakåt-strängKCNN4LYPD5: 43 785 874–43 827 206, bakåt-strängLYPD5ZNF283: 43 827 297–43 852 017, framåt-strängZNF283ZNF404: 43 864 321–43 901 831, bakåt-strängZNF404ZNF45: 43 910 549–43 935 306, bakåt-strängZNF45ZNF221: 43 951 204–43 972 739, framåt-strängZNF221ZNF155: 43 967 862–43 998 326, framåt-strängZNF155ZNF230: 44 002 934–44 013 924, framåt-strängZNF230ZNF222: 44 025 326–44 033 222, framåt-strängZNF222: 44 025 354–44 087 318, framåt-strängZNF223: 44 051 367–44 069 308, framåt-strängZNF223ZNF284: 44 072 138–44 089 613, framåt-strängZNF284ZNF224: 44 094 326–44 111 682, framåt-strängZNF224ZNF225: 44 112 181–44 135 473, framåt-strängZNF225ZNF234: 44 141 355–44 160 839, framåt-strängZNF234ZNF226: 44 165 069–44 178 381, framåt-strängZNF226ZNF227: 44 207 475–44 238 179, framåt-strängZNF227ZNF235: 44 228 729–44 305 046, bakåt-strängZNF235Diagram över SMG9: 14 exoner på bakåt-strängen av kromosom 19Exon 13: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 7: 2 kända sjukdomsorsakande ställenExon 4: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 3: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 14: 43 727 983–43 731 674, 3 692 baserExon 13: 43 732 858–43 733 002, 145 baserExon 12: 43 733 324–43 733 452, 129 baserExon 11: 43 733 626–43 733 733, 108 baserExon 10: 43 734 389–43 734 495, 107 baserExon 9: 43 737 597–43 737 682, 86 baserExon 8: 43 738 122–43 738 217, 96 baserExon 7: 43 740 107–43 740 218, 112 baserExon 6: 43 744 772–43 744 884, 113 baserExon 5: 43 747 442–43 747 539, 98 baserExon 4: 43 747 633–43 747 897, 265 baserExon 3: 43 747 978–43 748 052, 75 baserExon 2: 43 750 592–43 750 747, 156 baserExon 1: 43 754 654–43 754 962, 309 baser141210864215′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 5,5 kb av genens 27 kb, och 1 563 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av SMG9

2Låg

Hur svår SMG9 är att sekvensera med korta läsningar, av 100

  • Mappbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Upprepningar2,1 %
  • GC-innehåll14 %
  • Referenstäckning0 %

5

positioner i SMG9 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen

Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.

Ett helgenomsekvensering täcker alla 27 kb av SMG9, inklusive introner, inte bara de 5,5 kb exoner.

Egenskaper kopplade till SMG9

Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SMG9 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
  • Dataversion 2026.10.17-8666dff2.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). SMG9-genen: SMG9 nonsense mediated mRNA decay factor. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/smg9

Vancouver

Dante Labs. SMG9-genen: SMG9 nonsense mediated mRNA decay factor [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/smg9

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test