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Gene

ODC1

ornithine decarboxylase 1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
2p25.1
Coordinate
Cromosoma 2: 10.439.968–10.448.327 (GRCh38)
Esoni
12 esoni su 8,4 kb
Proteina
461 amminoacidi
Noto anche come
ODC
Trascritto MANE Select
ENST00000234111.9NM_002539.3
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora ODC1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di ODC1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
Cromosoma 2, con una parentesi dove si trova ODC1. ODC1 e 9 geni nelle vicinanze sul cromosoma 2, da 9.944.148 a 10.944.147.Cromosoma 22p25.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.310 Mb10,2 Mb10,4 Mb10,6 Mb10,8 MbGRHL1: 9.951.678–10.002.355, filamento direttoGRHL1KLF11: 10.042.849–10.054.958, filamento direttoKLF11CYS1: 10.056.473–10.080.944, filamento inversoCYS1RRM2: 10.120.698–10.213.114, filamento direttoRRM2HPCAL1: 10.297.410–10.427.835, filamento direttoHPCAL1ODC1: 10.439.968–10.448.327, filamento inversoODC1NOL10: 10.562.295–10.690.415, filamento inversoNOL10ATP6V1C2: 10.721.100–10.785.710, filamento direttoATP6V1C2PDIA6: 10.781.710–10.837.977, filamento inversoPDIA6KCNF1: 10.911.096–10.914.225, filamento direttoKCNF1Diagramma di ODC1: 12 esoni sul filamento inverso del cromosoma 2Esone 12: 3 siti noti causativi di malattiaEsone 11: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 6: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 12: 10.439.968–10.440.868, 901 basiEsone 11: 10.441.509–10.441.723, 215 basiEsone 10: 10.441.817–10.441.929, 113 basiEsone 9: 10.442.012–10.442.174, 163 basiEsone 8: 10.443.230–10.443.313, 84 basiEsone 7: 10.443.490–10.443.571, 82 basiEsone 6: 10.443.702–10.443.836, 135 basiEsone 5: 10.444.095–10.444.267, 173 basiEsone 4: 10.444.474–10.444.647, 174 basiEsone 3: 10.444.931–10.445.049, 119 basiEsone 2: 10.445.155–10.445.264, 110 basiEsone 1: 10.448.121–10.448.327, 207 basi1211109876543215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 2,5 kb dei 8,4 kb del gene; 1386 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge ODC1

6

posizioni in ODC1 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 8,4 kb di ODC1, introni inclusi, non solo i 2,5 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene ODC1: ornithine decarboxylase 1. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/odc1

Vancouver

Dante Labs. Gene ODC1: ornithine decarboxylase 1 [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/odc1

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