Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

ODC1

ornithine decarboxylase 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
2p25.1
Koordinaadid
Kromosoom 2: 10 439 968–10 448 327 (GRCh38)
Eksonid
12 eksonit, ulatus 8,4 kb
Valk
461 aminohapet
Tuntud ka kui
ODC
MANE Select transkript
ENST00000234111.9NM_002539.3
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni ODC1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas ODC1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
Kromosoom 2, millel on sulg kohal, kus asub ODC1. ODC1 ja sellele lähedal asuvad 9 geeni kromosoomil 2, vahemikus 9 944 148 kuni 10 944 147.Kromosoom 22p25.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.310 Mb10,2 Mb10,4 Mb10,6 Mb10,8 MbGRHL1: 9 951 678–10 002 355, otsene ahelGRHL1KLF11: 10 042 849–10 054 958, otsene ahelKLF11CYS1: 10 056 473–10 080 944, pöördne ahelCYS1RRM2: 10 120 698–10 213 114, otsene ahelRRM2HPCAL1: 10 297 410–10 427 835, otsene ahelHPCAL1ODC1: 10 439 968–10 448 327, pöördne ahelODC1NOL10: 10 562 295–10 690 415, pöördne ahelNOL10ATP6V1C2: 10 721 100–10 785 710, otsene ahelATP6V1C2PDIA6: 10 781 710–10 837 977, pöördne ahelPDIA6KCNF1: 10 911 096–10 914 225, otsene ahelKCNF1ODC1 skeem: 12 eksonit kromosoomi 2 pöördne ahelalEkson 12: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 11: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 6: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 12: 10 439 968–10 440 868, 901 alustEkson 11: 10 441 509–10 441 723, 215 alustEkson 10: 10 441 817–10 441 929, 113 alustEkson 9: 10 442 012–10 442 174, 163 alustEkson 8: 10 443 230–10 443 313, 84 alustEkson 7: 10 443 490–10 443 571, 82 alustEkson 6: 10 443 702–10 443 836, 135 alustEkson 5: 10 444 095–10 444 267, 173 alustEkson 4: 10 444 474–10 444 647, 174 alustEkson 3: 10 444 931–10 445 049, 119 alustEkson 2: 10 445 155–10 445 264, 110 alustEkson 1: 10 448 121–10 448 327, 207 alust1211109876543215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2,5 kb kogupikkusega 8,4 kb; neist 1386 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse ODC1

6

kohad geenis ODC1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni ODC1 8,4 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2,5 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). ODC1 geen: ornithine decarboxylase 1. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/odc1

Vancouver

Dante Labs. ODC1 geen: ornithine decarboxylase 1 [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/odc1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test