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Gène

SYNCRIP

synaptotagmin binding cytoplasmic RNA interacting protein

Résumé

Localisation cytogénétique
6q14.3
Coordonnées
Chromosome 6 : 85 613 976–85 642 886 (GRCh38)
Exons
11 exons sur 28,9 kb
Protéine
623 acides aminés
Aussi appelé
NSAP1, GRY-RBP, dJ3J17.2, HNRPQ1, hnRNP-Q, HNRNPQ
Transcrit MANE Select
ENST00000369622.8NM_006372.5
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SYNCRIP. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SYNCRIP

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 6, avec un crochet à l'emplacement de SYNCRIP. SYNCRIP et 3 gènes à proximité sur le chromosome 6, de 85 128 431 à 86 128 430.Chromosome 66q14.3p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2785,2 Mb85,4 Mb85,6 Mb85,8 Mb86 MbNT5E : 85 449 584–85 547 684, brin directNT5E : 85 504 776–85 678 733, brin inverseSNX14 : 85 504 776–85 594 156, brin inverseSNX14SYNCRIP : 85 613 976–85 642 886, brin inverseSYNCRIPSchéma de SYNCRIP : 11 exons sur le brin inverse du chromosome 6Exon 11 : 1 site connu associé à une maladieExon 11 : 85 613 976–85 615 347, 1 372 basesExon 10 : 85 618 818–85 618 939, 122 basesExon 9 : 85 619 268–85 619 417, 150 basesExon 8 : 85 622 482–85 622 687, 206 basesExon 7 : 85 623 977–85 624 112, 136 basesExon 6 : 85 636 967–85 637 143, 177 basesExon 5 : 85 637 243–85 637 356, 114 basesExon 4 : 85 640 221–85 640 328, 108 basesExon 3 : 85 640 446–85 640 564, 119 basesExon 2 : 85 641 292–85 641 451, 160 basesExon 1 : 85 642 797–85 642 886, 90 bases1110864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,8 kb sur les 28,9 kb du gène ; 1 872 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit SYNCRIP

1

position dans SYNCRIP où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

1 d'entre elles (100 %) se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

  • Low mappability (1 site)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.

Un génome entier couvre les 28,9 kb de SYNCRIP, introns compris, et pas seulement les 2,8 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SYNCRIP : synaptotagmin binding cytoplasmic RNA interacting protein. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/syncrip

Vancouver

Dante Labs. Gène SYNCRIP : synaptotagmin binding cytoplasmic RNA interacting protein [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/syncrip

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