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Gène

GGT6

gamma-glutamyltransferase 6

Résumé

Localisation cytogénétique
17p13.2
Coordonnées
Chromosome 17 : 4 556 927–4 560 577 (GRCh38)
Exons
4 exons sur 3,7 kb
Protéine
499 acides aminés
Aussi appelé
FLJ90165
Transcrit MANE Select
ENST00000381550.8NM_001288702.2
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore GGT6. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de GGT6

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 17, avec un crochet à l'emplacement de GGT6. GGT6 et 33 gènes à proximité sur le chromosome 17, de 4 058 752 à 5 058 751.Chromosome 1717p13.2p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.34,2 Mb4,4 Mb4,6 Mb4,8 Mb5 MbZZEF1 : 4 004 432–4 143 628, brin inverseZZEF1CYB5D2 : 4 143 168–4 188 683, brin directCYB5D2ANKFY1 : 4 163 821–4 263 995, brin inverseANKFY1UBE2G1 : 4 269 221–4 366 678, brin inverseUBE2G1SPNS3 : 4 433 940–4 488 208, brin directSPNS3SPNS2 : 4 498 839–4 539 036, brin directSPNS2MYBBP1A : 4 538 897–4 555 403, brin inverseMYBBP1AGGT6 : 4 556 927–4 560 577, brin inverseGGT6SMTNL2 : 4 583 999–4 608 798, brin directSMTNL2ALOX15 : 4 629 736–4 642 294, brin inverseALOX15PELP1 : 4 669 774–4 704 337, brin inversePELP1ARRB2 : 4 710 393–4 721 500, brin directARRB2MED11 : 4 731 411–4 733 610, brin directMED11CXCL16 : 4 732 915–4 740 064, brin inverseCXCL16ZMYND15 : 4 739 108–4 746 119, brin directTM4SF5 : 4 771 835–4 783 220, brin directTM4SF5VMO1 : 4 785 281–4 790 406, brin inverseVMO1GLTPD2 : 4 788 927–4 790 734, brin directGLTPD2PSMB6 : 4 796 144–4 798 503, brin directPSMB6C17orf114 : 4 801 159–4 807 013, brin inversePLD2 : 4 807 074–4 823 434, brin directMINK1 : 4 833 147–4 898 065, brin directMINK1CHRNE : 4 897 769–4 934 438, brin inverseCHRNEC17orf107 : 4 899 418–4 902 934, brin directC17orf107GP1BA : 4 932 261–4 935 023, brin directGP1BASLC25A11 : 4 934 570–4 940 156, brin inverseSLC25A11RNF167 : 4 939 997–4 945 223, brin directPFN1 : 4 945 652–4 950 517, brin inverseENO3 : 4 948 034–4 957 132, brin directSPAG7 : 4 959 226–4 967 835, brin inverseCAMTA2 : 4 967 992–4 987 684, brin inverseINCA1 : 4 988 130–4 999 117, brin inverseINCA1KIF1C : 4 997 629–5 028 401, brin directKIF1CSLC52A1 : 5 032 600–5 052 009, brin inverseSLC52A1Schéma de GGT6 : 4 exons sur le brin inverse du chromosome 17Exon 4 : 4 556 927–4 559 057, 2 131 basesExon 3 : 4 559 343–4 559 456, 114 basesExon 2 : 4 559 558–4 559 760, 203 basesExon 1 : 4 560 382–4 560 577, 196 bases43215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,6 kb sur les 3,7 kb du gène ; 1 500 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de GGT6

5Faible

Difficulté de séquençage de GGT6 avec des lectures courtes, sur 100

  • Cartographiabilité0,8 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions6,4 %
  • Teneur en GC39 %
  • Couverture de référence0 %

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène GGT6 : gamma-glutamyltransferase 6. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ggt6

Vancouver

Dante Labs. Gène GGT6 : gamma-glutamyltransferase 6 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ggt6

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