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Gène

CXCL16

C-X-C motif chemokine ligand 16

Résumé

Localisation cytogénétique
17p13.2
Coordonnées
Chromosome 17 : 4 733 533–4 739 928 (GRCh38)
Exons
6 exons sur 6,4 kb
Protéine
254 acides aminés
Aussi appelé
SR-PSOX, CXCLG16, SRPSOX
Transcrit MANE Select
ENST00000293778.12NM_001386809.1
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore CXCL16. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de CXCL16

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 17, avec un crochet à l'emplacement de CXCL16. CXCL16 et 36 gènes à proximité sur le chromosome 17, de 4 236 731 à 5 236 730.Chromosome 1717p13.2p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.34,4 Mb4,6 Mb4,8 Mb5 Mb5,2 MbANKFY1 : 4 163 821–4 263 995, brin inverseANKFY1UBE2G1 : 4 269 221–4 366 678, brin inverseUBE2G1SPNS3 : 4 433 940–4 488 208, brin directSPNS3SPNS2 : 4 498 839–4 539 036, brin directSPNS2MYBBP1A : 4 538 897–4 555 403, brin inverseMYBBP1AGGT6 : 4 556 342–4 560 818, brin inverseGGT6SMTNL2 : 4 583 999–4 608 798, brin directSMTNL2ALOX15 : 4 629 736–4 642 294, brin inverseALOX15PELP1 : 4 669 774–4 704 337, brin inverseARRB2 : 4 710 393–4 721 500, brin directARRB2MED11 : 4 731 411–4 733 610, brin directMED11CXCL16 : 4 733 533–4 739 928, brin inverseCXCL16ZMYND15 : 4 739 108–4 746 119, brin directZMYND15TM4SF5 : 4 771 835–4 783 220, brin directTM4SF5VMO1 : 4 785 281–4 790 406, brin inverseVMO1GLTPD2 : 4 788 927–4 790 734, brin directPSMB6 : 4 796 144–4 798 503, brin directC17orf114 : 4 801 159–4 807 013, brin inversePLD2 : 4 807 074–4 823 434, brin directPLD2MINK1 : 4 833 147–4 898 065, brin directMINK1CHRNE : 4 897 769–4 934 438, brin inverseCHRNEC17orf107 : 4 899 418–4 902 934, brin directC17orf107GP1BA : 4 932 261–4 935 023, brin directGP1BASLC25A11 : 4 934 570–4 940 156, brin inverseSLC25A11RNF167 : 4 939 997–4 945 223, brin directPFN1 : 4 945 652–4 950 517, brin inverseENO3 : 4 948 034–4 957 132, brin directSPAG7 : 4 959 226–4 967 835, brin inverseCAMTA2 : 4 967 992–4 987 684, brin inverseINCA1 : 4 988 130–4 999 117, brin inverseINCA1KIF1C : 4 997 629–5 028 401, brin directKIF1CSLC52A1 : 5 032 600–5 052 009, brin inverseSLC52A1ZFP3 : 5 078 241–5 096 376, brin directZFP3ZNF232 : 5 105 269–5 123 162, brin inverseZNF232USP6 : 5 116 032–5 175 034, brin directUSP6ZNF594 : 5 174 019–5 191 907, brin inverseZNF594SCIMP : 5 208 915–5 234 869, brin inverseSCIMPSchéma de CXCL16 : 6 exons sur le brin inverse du chromosome 17Exon 6 : 4 733 533–4 734 479, 947 basesExon 5 : 4 734 583–4 734 652, 70 basesExon 4 : 4 735 092–4 735 508, 417 basesExon 3 : 4 738 408–4 738 490, 83 basesExon 2 : 4 738 782–4 738 920, 139 basesExon 1 : 4 739 261–4 739 928, 668 bases6543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,3 kb sur les 6,4 kb du gène ; 765 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène CXCL16 : C-X-C motif chemokine ligand 16. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/cxcl16

Vancouver

Dante Labs. Gène CXCL16 : C-X-C motif chemokine ligand 16 [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/cxcl16

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