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Gène

SOX6

SRY-box transcription factor 6

Résumé

Localisation cytogénétique
11p15.2
Coordonnées
Chromosome 11 : 15 966 449–16 356 546 (GRCh38)
Exons
16 exons sur 390,1 kb
Protéine
828 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000683767.1NM_001367873.1
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SOX6. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SOX6

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 11, avec un crochet à l'emplacement de SOX6. SOX6 et 1 gène à proximité sur le chromosome 11, de 15 576 351 à 16 746 644.Chromosome 1111p15.2p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2515,6 Mb15,8 Mb16 Mb16,2 Mb16,4 Mb16,6 MbSOX6 : 15 966 449–16 356 546, brin inverseSOX6C11orf58 : 16 613 132–16 758 340, brin directC11orf58Schéma de SOX6 : 16 exons sur le brin inverse du chromosome 11Exon 16 : 1 site connu associé à une maladieExon 15 : 3 sites connus associés à une maladieExon 14 : 1 site connu associé à une maladieExon 12 : 3 sites connus associés à une maladieExon 11 : 1 site connu associé à une maladieExon 10 : 1 site connu associé à une maladieExon 8 : 2 sites connus associés à une maladieExon 7 : 1 site connu associé à une maladieExon 6 : 1 site connu associé à une maladieExon 4 : 1 site connu associé à une maladieExon 3 : 1 site connu associé à une maladieExon 16 : 15 966 449–15 973 112, 6 664 basesExon 15 : 15 986 204–15 986 420, 217 basesExon 14 : 15 988 997–15 989 230, 234 basesExon 13 : 16 014 942–16 015 050, 109 basesExon 12 : 16 046 514–16 046 701, 188 basesExon 11 : 16 049 755–16 049 938, 184 basesExon 10 : 16 055 752–16 055 901, 150 basesExon 9 : 16 095 996–16 096 118, 123 basesExon 8 : 16 097 609–16 097 688, 80 basesExon 7 : 16 111 803–16 111 923, 121 basesExon 6 : 16 183 886–16 183 954, 69 basesExon 5 : 16 186 783–16 186 955, 173 basesExon 4 : 16 234 582–16 234 671, 90 basesExon 3 : 16 318 446–16 318 653, 208 basesExon 2 : 16 341 012–16 341 252, 241 basesExon 1 : 16 356 094–16 356 546, 453 bases16141210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 9,3 kb sur les 390,1 kb du gène ; 2 487 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de SOX6

18

positions de SOX6 où ClinVar classe une variante comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 390,1 kb de SOX6, introns compris, et pas seulement les 9,3 kb d'exons.

Traits associés à SOX6

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que SOX6 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SOX6 : SRY-box transcription factor 6. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/sox6

Vancouver

Dante Labs. Gène SOX6 : SRY-box transcription factor 6 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/sox6

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