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Gène

GAN

gigaxonin

Résumé

Localisation cytogénétique
16q23.2
Coordonnées
Chromosome 16 : 81 314 962–81 390 809 (GRCh38)
Exons
11 exons sur 75,8 kb
Protéine
597 acides aminés
Aussi appelé
GAN1, KLHL16, GIG
Transcrit MANE Select
ENST00000648994.2NM_022041.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore GAN. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de GAN

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 16, avec un crochet à l'emplacement de GAN. GAN et 12 gènes à proximité sur le chromosome 16, de 80 852 886 à 81 852 885.Chromosome 1616q23.2p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.381 Mb81,2 Mb81,4 Mb81,6 Mb81,8 Mb : 80 828 736–81 006 894, brin inverseCMC2 : 80 966 448–81 020 270, brin inverseCMC2CENPN : 81 006 506–81 033 558, brin directCENPN : 81 022 316–81 096 284, brin inverseATMIN : 81 035 809–81 047 350, brin directC16orf46 : 81 053 195–81 077 267, brin inverseC16orf46 : 81 053 587–81 096 296, brin inverseGCSH : 81 078 232–81 096 426, brin inverseGCSHPKD1L2 : 81 100 875–81 220 370, brin inversePKD1L2BCO1 : 81 238 576–81 291 226, brin directBCO1GAN : 81 314 962–81 390 809, brin directGANCMIP : 81 444 800–81 711 762, brin directCMIPPLCG2 : 81 738 248–81 962 685, brin directPLCG2Schéma de GAN : 11 exons sur le brin direct du chromosome 16Exon 1 : 1 site connu associé à une maladieExon 2 : 2 sites connus associés à une maladieExon 3 : 12 sites connus associés à une maladieExon 4 : 4 sites connus associés à une maladieExon 5 : 6 sites connus associés à une maladieExon 6 : 5 sites connus associés à une maladieExon 7 : 5 sites connus associés à une maladieExon 8 : 2 sites connus associés à une maladieExon 9 : 3 sites connus associés à une maladieExon 10 : 1 site connu associé à une maladieExon 11 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 81 314 962–81 315 280, 319 basesExon 2 : 81 351 583–81 351 697, 115 basesExon 3 : 81 354 405–81 354 755, 351 basesExon 4 : 81 356 785–81 357 002, 218 basesExon 5 : 81 357 810–81 357 931, 122 basesExon 6 : 81 362 499–81 362 611, 113 basesExon 7 : 81 363 794–81 363 943, 150 basesExon 8 : 81 364 974–81 365 110, 137 basesExon 9 : 81 365 350–81 365 478, 129 basesExon 10 : 81 377 219–81 377 328, 110 basesExon 11 : 81 377 415–81 390 809, 13 395 bases1246810115′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 15,2 kb sur les 75,8 kb du gène ; 1 794 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit GAN

51

positions dans GAN où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 75,8 kb de GAN, introns compris, et pas seulement les 15,2 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène GAN : gigaxonin. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/gan

Vancouver

Dante Labs. Gène GAN : gigaxonin [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/gan

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