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Gène

CCDC88A

coiled-coil and HOOK domain protein 88A

Résumé

Localisation cytogénétique
2p16.1
Coordonnées
Chromosome 2 : 55 287 842–55 419 856 (GRCh38)
Exons
33 exons sur 132 kb
Protéine
1 871 acides aminés
Aussi appelé
FLJ10392, APE, GIV, HkRP1, GRDN
Symboles précédents
KIAA1212
Transcrit MANE Select
ENST00000436346.7NM_001365480.1
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore CCDC88A. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de CCDC88A

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 2, avec un crochet à l'emplacement de CCDC88A. CCDC88A et 9 gènes à proximité sur le chromosome 2, de 54 853 849 à 55 853 848.Chromosome 22p16.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.355 Mb55,2 Mb55,4 Mb55,6 Mb55,8 MbEML6 : 54 723 499–54 972 025, brin directEML6RTN4 : 54 971 931–55 112 621, brin inverseRTN4CLHC1 : 55 172 547–55 232 563, brin inverseCLHC1RPS27A : 55 229 447–55 236 649, brin directRPS27AMTIF2 : 55 236 218–55 270 263, brin inverseMTIF2CCDC88A : 55 287 842–55 419 856, brin inverseCCDC88ACFAP36 : 55 519 559–55 545 501, brin directCFAP36PPP4R3B : 55 547 292–55 618 880, brin inversePPP4R3BPNPT1 : 55 634 061–55 693 863, brin inversePNPT1EFEMP1 : 55 810 992–55 924 271, brin inverseEFEMP1Schéma de CCDC88A : 33 exons sur le brin inverse du chromosome 2Exon 33 : 55 287 842–55 291 164, 3 323 basesExon 32 : 55 291 676–55 291 775, 100 basesExon 31 : 55 295 597–55 296 056, 460 basesExon 30 : 55 296 258–55 296 523, 266 basesExon 29 : 55 299 839–55 299 919, 81 basesExon 28 : 55 301 206–55 301 277, 72 basesExon 27 : 55 301 872–55 302 072, 201 basesExon 26 : 55 303 069–55 303 152, 84 basesExon 25 : 55 308 809–55 309 023, 215 basesExon 24 : 55 309 162–55 309 254, 93 basesExon 23 : 55 312 434–55 312 579, 146 basesExon 22 : 55 315 928–55 316 114, 187 basesExon 21 : 55 317 206–55 317 349, 144 basesExon 20 : 55 317 564–55 317 841, 278 basesExon 19 : 55 318 843–55 319 004, 162 basesExon 18 : 55 322 528–55 322 692, 165 basesExon 17 : 55 328 294–55 328 435, 142 basesExon 16 : 55 332 566–55 332 693, 128 basesExon 15 : 55 334 094–55 335 164, 1 071 basesExon 14 : 55 336 681–55 336 818, 138 basesExon 13 : 55 339 464–55 339 648, 185 basesExon 12 : 55 343 648–55 343 792, 145 basesExon 11 : 55 344 368–55 344 514, 147 basesExon 10 : 55 346 175–55 346 333, 159 basesExon 9 : 55 349 518–55 349 599, 82 basesExon 8 : 55 355 579–55 355 751, 173 basesExon 7 : 55 362 308–55 362 448, 141 basesExon 6 : 55 363 950–55 364 033, 84 basesExon 5 : 55 372 452–55 372 510, 59 basesExon 4 : 55 374 814–55 374 883, 70 basesExon 3 : 55 388 778–55 388 886, 109 basesExon 2 : 55 418 816–55 418 916, 101 basesExon 1 : 55 419 017–55 419 856, 840 bases333025201510515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 9,8 kb sur les 132 kb du gène ; 5 616 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène CCDC88A : coiled-coil and HOOK domain protein 88A. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ccdc88a

Vancouver

Dante Labs. Gène CCDC88A : coiled-coil and HOOK domain protein 88A [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ccdc88a

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