Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

SSC5D

scavenger receptor cysteine rich family member with 5 domains

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
19q13.42
Koordinaadid
Kromosoom 19: 55 488 436–55 519 099 (GRCh38)
Eksonid
14 eksonit, ulatus 30,7 kb
Valk
1573 aminohapet
Tuntud ka kui
FLJ35258, S5D-SRCRB
MANE Select transkript
ENST00000389623.11NM_001144950.2
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SSC5D veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SSC5D on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 19, millel on sulg kohal, kus asub SSC5D. SSC5D ja sellele lähedal asuvad 49 geeni kromosoomil 19, vahemikus 55 003 768 kuni 56 003 767.Kromosoom 1919q13.42p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4355,2 Mb55,4 Mb55,6 Mb55,8 Mb56 MbGP6: 55 012 055–55 038 264, pöördne ahelGP6RDH13: 55 039 108–55 071 291, pöördne ahelRDH13EPS8L1: 55 072 020–55 090 124, otsene ahelEPS8L1PPP1R12C: 55 090 913–55 117 679, pöördne ahelPPP1R12CTNNT1: 55 131 662–55 149 351, pöördne ahelTNNI3: 55 151 763–55 157 774, pöördne ahelTNNI3: 55 154 757–55 160 671, pöördne ahelDNAAF3: 55 158 661–55 166 722, pöördne ahelDNAAF3SYT5: 55 171 196–55 180 328, pöördne ahelSYT5PTPRH: 55 181 230–55 209 512, pöördne ahelPTPRHTMEM86B: 55 226 524–55 228 784, pöördne ahelTMEM86BPPP6R1: 55 229 776–55 259 070, pöördne ahelPPP6R1HSPBP1: 55 262 219–55 280 930, pöördne ahelHSPBP1BRSK1: 55 282 072–55 312 592, otsene ahelBRSK1TMEM150B: 55 309 440–55 334 048, pöördne ahelKMT5C: 55 339 367–55 348 122, otsene ahelCOX6B2: 55 349 306–55 354 754, pöördne ahel: 55 352 301–55 359 516, pöördne ahelGARIN5B: 55 354 908–55 363 260, pöördne ahelIL11: 55 364 382–55 370 463, pöördne ahelTMEM190: 55 376 816–55 378 246, otsene ahelTMEM190TMEM238: 55 379 244–55 384 305, pöördne ahelTMEM238RPL28: 55 383 856–55 403 342, otsene ahelRPL28UBE2S: 55 385 311–55 408 164, pöördne ahelUBE2SSHISA7: 55 428 740–55 452 900, pöördne ahelISOC2: 55 452 975–55 462 343, pöördne ahelC19orf85: 55 463 001–55 464 752, pöördne ahelC19orf85ZNF628: 55 476 597–55 484 487, otsene ahelZNF628NAT14: 55 484 949–55 487 578, otsene ahelNAT14SSC5D: 55 488 436–55 519 099, otsene ahelSSC5DSBK2: 55 528 607–55 537 143, pöördne ahelSBK2SBK3: 55 539 018–55 550 284, pöördne ahelSBK3ZNF579: 55 576 774–55 580 921, pöördne ahelZNF579FIZ1: 55 591 371–55 606 194, pöördne ahelFIZ1ZNF524: 55 599 714–55 603 592, otsene ahelZNF524ZNF865: 55 605 502–55 617 269, otsene ahelZNF865ZNF784: 55 620 741–55 624 570, pöördne ahelZNF581: 55 624 664–55 647 294, otsene ahelZNF580: 55 635 003–55 643 470, otsene ahelCCDC106: 55 640 967–55 653 161, otsene ahelU2AF2: 55 654 115–55 674 717, otsene ahelEPN1: 55 675 109–55 709 858, otsene ahelEPN1NLRP9: 55 708 438–55 738 402, pöördne ahelNLRP9RFPL4A: 55 759 043–55 763 424, otsene ahelRFPL4ARFPL4AL1: 55 769 118–55 773 420, otsene ahelRFPL4AL1NLRP11: 55 785 397–55 836 800, pöördne ahelNLRP11NLRP4: 55 836 540–55 881 855, otsene ahelNLRP4NLRP13: 55 891 699–55 932 336, pöördne ahelNLRP13NLRP8: 55 947 832–55 981 158, otsene ahelNLRP8NLRP5: 55 986 775–56 061 810, otsene ahelNLRP5SSC5D skeem: 14 eksonit kromosoomi 19 otsene ahelalEkson 1: 55 488 436–55 488 614, 179 alustEkson 2: 55 489 006–55 489 032, 27 alustEkson 3: 55 489 354–55 489 662, 309 alustEkson 4: 55 489 882–55 489 995, 114 alustEkson 5: 55 490 298–55 490 408, 111 alustEkson 6: 55 490 772–55 491 080, 309 alustEkson 7: 55 493 595–55 493 912, 318 alustEkson 8: 55 494 610–55 494 783, 174 alustEkson 9: 55 497 880–55 498 197, 318 alustEkson 10: 55 499 816–55 500 412, 597 alustEkson 11: 55 500 490–55 500 804, 315 alustEkson 12: 55 501 034–55 501 201, 168 alustEkson 13: 55 513 011–55 513 172, 162 alustEkson 14: 55 517 224–55 519 099, 1876 alust124681012145′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 5 kb kogupikkusega 30,7 kb; neist 4722 alust kodeerivad valku.

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SSC5D geen: scavenger receptor cysteine rich family member with 5 domains. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/ssc5d

Vancouver

Dante Labs. SSC5D geen: scavenger receptor cysteine rich family member with 5 domains [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/ssc5d

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test