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Gene

SSC5D

scavenger receptor cysteine rich family member with 5 domains

Resumo

Localização citogenética
19q13.42
Coordenadas
Cromossoma 19: 55 488 436–55 519 099 (GRCh38)
Exões
14 exões ao longo de 30,7 kb
Proteína
1573 aminoácidos
Também conhecido como
FLJ35258, S5D-SRCRB
Transcrito MANE Select
ENST00000389623.11NM_001144950.2
Tipo de locus
gene with protein product
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa SSC5D ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como SSC5D está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 19, com um parêntese onde se situa SSC5D. SSC5D e 49 genes próximos no cromossoma 19, de 55 003 768 a 56 003 767.Cromossoma 1919q13.42p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4355,2 Mb55,4 Mb55,6 Mb55,8 Mb56 MbGP6: 55 012 055–55 038 264, fita inversaGP6RDH13: 55 039 108–55 071 291, fita inversaRDH13EPS8L1: 55 072 020–55 090 124, fita diretaEPS8L1PPP1R12C: 55 090 913–55 117 679, fita inversaPPP1R12CTNNT1: 55 131 662–55 149 351, fita inversaTNNI3: 55 151 763–55 157 774, fita inversaTNNI3: 55 154 757–55 160 671, fita inversaDNAAF3: 55 158 661–55 166 722, fita inversaDNAAF3SYT5: 55 171 196–55 180 328, fita inversaSYT5PTPRH: 55 181 230–55 209 512, fita inversaPTPRHTMEM86B: 55 226 524–55 228 784, fita inversaTMEM86BPPP6R1: 55 229 776–55 259 070, fita inversaPPP6R1HSPBP1: 55 262 219–55 280 930, fita inversaHSPBP1BRSK1: 55 282 072–55 312 592, fita diretaBRSK1TMEM150B: 55 309 440–55 334 048, fita inversaKMT5C: 55 339 367–55 348 122, fita diretaCOX6B2: 55 349 306–55 354 754, fita inversa: 55 352 301–55 359 516, fita inversaGARIN5B: 55 354 908–55 363 260, fita inversaIL11: 55 364 382–55 370 463, fita inversaTMEM190: 55 376 816–55 378 246, fita diretaTMEM190TMEM238: 55 379 244–55 384 305, fita inversaTMEM238RPL28: 55 383 856–55 403 342, fita diretaRPL28UBE2S: 55 385 311–55 408 164, fita inversaUBE2SSHISA7: 55 428 740–55 452 900, fita inversaISOC2: 55 452 975–55 462 343, fita inversaC19orf85: 55 463 001–55 464 752, fita inversaC19orf85ZNF628: 55 476 597–55 484 487, fita diretaZNF628NAT14: 55 484 949–55 487 578, fita diretaNAT14SSC5D: 55 488 436–55 519 099, fita diretaSSC5DSBK2: 55 528 607–55 537 143, fita inversaSBK2SBK3: 55 539 018–55 550 284, fita inversaSBK3ZNF579: 55 576 774–55 580 921, fita inversaZNF579FIZ1: 55 591 371–55 606 194, fita inversaFIZ1ZNF524: 55 599 714–55 603 592, fita diretaZNF524ZNF865: 55 605 502–55 617 269, fita diretaZNF865ZNF784: 55 620 741–55 624 570, fita inversaZNF581: 55 624 664–55 647 294, fita diretaZNF580: 55 635 003–55 643 470, fita diretaCCDC106: 55 640 967–55 653 161, fita diretaU2AF2: 55 654 115–55 674 717, fita diretaEPN1: 55 675 109–55 709 858, fita diretaEPN1NLRP9: 55 708 438–55 738 402, fita inversaNLRP9RFPL4A: 55 759 043–55 763 424, fita diretaRFPL4ARFPL4AL1: 55 769 118–55 773 420, fita diretaRFPL4AL1NLRP11: 55 785 397–55 836 800, fita inversaNLRP11NLRP4: 55 836 540–55 881 855, fita diretaNLRP4NLRP13: 55 891 699–55 932 336, fita inversaNLRP13NLRP8: 55 947 832–55 981 158, fita diretaNLRP8NLRP5: 55 986 775–56 061 810, fita diretaNLRP5Diagrama de SSC5D: 14 exões na cadeia direta do cromossoma 19Exão 1: 55 488 436–55 488 614, 179 basesExão 2: 55 489 006–55 489 032, 27 basesExão 3: 55 489 354–55 489 662, 309 basesExão 4: 55 489 882–55 489 995, 114 basesExão 5: 55 490 298–55 490 408, 111 basesExão 6: 55 490 772–55 491 080, 309 basesExão 7: 55 493 595–55 493 912, 318 basesExão 8: 55 494 610–55 494 783, 174 basesExão 9: 55 497 880–55 498 197, 318 basesExão 10: 55 499 816–55 500 412, 597 basesExão 11: 55 500 490–55 500 804, 315 basesExão 12: 55 501 034–55 501 201, 168 basesExão 13: 55 513 011–55 513 172, 162 basesExão 14: 55 517 224–55 519 099, 1876 bases124681012145′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 5 kb dos 30,7 kb do gene; 4722 dessas bases codificam a proteína.

Ligações externas

De onde vem esta informação

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene SSC5D: scavenger receptor cysteine rich family member with 5 domains. Consultado em 17 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/ssc5d

Vancouver

Dante Labs. Gene SSC5D: scavenger receptor cysteine rich family member with 5 domains [Internet]. [consultado em 17 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/ssc5d

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