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Gen

SSC5D

scavenger receptor cysteine rich family member with 5 domains

Resumen

Localización citogenética
19q13.42
Coordenadas
Cromosoma 19: 55.488.436–55.519.099 (GRCh38)
Exones
14 exones en 30,7 kb
Proteína
1573 aminoácidos
También conocido como
FLJ35258, S5D-SRCRB
Transcrito MANE Select
ENST00000389623.11NM_001144950.2
Tipo de locus
gene with protein product
  • Muy alta
  • Alta
  • Baja
  • Muy baja

Informes revisados relevantes para este gen

Ningún informe de Genome Test lee aún SSC5D. La prueba secuencia todo su genoma, así que sus datos lo incluyen igualmente.

Estructura de SSC5D

  • Secuencia codificante
  • Región no traducida
  • Intrón
  • Sentido de la transcripción
  • Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Cromosoma 19, con un corchete donde se ubica SSC5D. SSC5D y 49 genes cercanos en el cromosoma 19, desde 55.003.768 hasta 56.003.767.Cromosoma 1919q13.42p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4355,2 Mb55,4 Mb55,6 Mb55,8 Mb56 MbGP6: 55.012.055–55.038.264, hebra inversaGP6RDH13: 55.039.108–55.071.291, hebra inversaRDH13EPS8L1: 55.072.020–55.090.124, hebra directaEPS8L1PPP1R12C: 55.090.913–55.117.679, hebra inversaPPP1R12CTNNT1: 55.131.662–55.149.351, hebra inversaTNNI3: 55.151.763–55.157.774, hebra inversaTNNI3: 55.154.757–55.160.671, hebra inversaDNAAF3: 55.158.661–55.166.722, hebra inversaDNAAF3SYT5: 55.171.196–55.180.328, hebra inversaSYT5PTPRH: 55.181.230–55.209.512, hebra inversaPTPRHTMEM86B: 55.226.524–55.228.784, hebra inversaTMEM86BPPP6R1: 55.229.776–55.259.070, hebra inversaPPP6R1HSPBP1: 55.262.219–55.280.930, hebra inversaHSPBP1BRSK1: 55.282.072–55.312.592, hebra directaBRSK1TMEM150B: 55.309.440–55.334.048, hebra inversaKMT5C: 55.339.367–55.348.122, hebra directaCOX6B2: 55.349.306–55.354.754, hebra inversa: 55.352.301–55.359.516, hebra inversaGARIN5B: 55.354.908–55.363.260, hebra inversaIL11: 55.364.382–55.370.463, hebra inversaTMEM190: 55.376.816–55.378.246, hebra directaTMEM190TMEM238: 55.379.244–55.384.305, hebra inversaTMEM238RPL28: 55.383.856–55.403.342, hebra directaRPL28UBE2S: 55.385.311–55.408.164, hebra inversaUBE2SSHISA7: 55.428.740–55.452.900, hebra inversaISOC2: 55.452.975–55.462.343, hebra inversaC19orf85: 55.463.001–55.464.752, hebra inversaC19orf85ZNF628: 55.476.597–55.484.487, hebra directaZNF628NAT14: 55.484.949–55.487.578, hebra directaNAT14SSC5D: 55.488.436–55.519.099, hebra directaSSC5DSBK2: 55.528.607–55.537.143, hebra inversaSBK2SBK3: 55.539.018–55.550.284, hebra inversaSBK3ZNF579: 55.576.774–55.580.921, hebra inversaZNF579FIZ1: 55.591.371–55.606.194, hebra inversaFIZ1ZNF524: 55.599.714–55.603.592, hebra directaZNF524ZNF865: 55.605.502–55.617.269, hebra directaZNF865ZNF784: 55.620.741–55.624.570, hebra inversaZNF581: 55.624.664–55.647.294, hebra directaZNF580: 55.635.003–55.643.470, hebra directaCCDC106: 55.640.967–55.653.161, hebra directaU2AF2: 55.654.115–55.674.717, hebra directaEPN1: 55.675.109–55.709.858, hebra directaEPN1NLRP9: 55.708.438–55.738.402, hebra inversaNLRP9RFPL4A: 55.759.043–55.763.424, hebra directaRFPL4ARFPL4AL1: 55.769.118–55.773.420, hebra directaRFPL4AL1NLRP11: 55.785.397–55.836.800, hebra inversaNLRP11NLRP4: 55.836.540–55.881.855, hebra directaNLRP4NLRP13: 55.891.699–55.932.336, hebra inversaNLRP13NLRP8: 55.947.832–55.981.158, hebra directaNLRP8NLRP5: 55.986.775–56.061.810, hebra directaNLRP5Diagrama de SSC5D: 14 exones en la hebra directa del cromosoma 19Exón 1: 55.488.436–55.488.614, 179 basesExón 2: 55.489.006–55.489.032, 27 basesExón 3: 55.489.354–55.489.662, 309 basesExón 4: 55.489.882–55.489.995, 114 basesExón 5: 55.490.298–55.490.408, 111 basesExón 6: 55.490.772–55.491.080, 309 basesExón 7: 55.493.595–55.493.912, 318 basesExón 8: 55.494.610–55.494.783, 174 basesExón 9: 55.497.880–55.498.197, 318 basesExón 10: 55.499.816–55.500.412, 597 basesExón 11: 55.500.490–55.500.804, 315 basesExón 12: 55.501.034–55.501.201, 168 basesExón 13: 55.513.011–55.513.172, 162 basesExón 14: 55.517.224–55.519.099, 1876 bases124681012145′3′

Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.

Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).

Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.

Los exones suman 5 kb de los 30,7 kb del gen; 4722 de esas bases codifican la proteína.

Enlaces externos

Origen de estos datos

  • HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su ubicación.
  • MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.

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APA

Dante Labs. (s. f.). Gen SSC5D: scavenger receptor cysteine rich family member with 5 domains. Consultado el 17 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/ssc5d

Vancouver

Dante Labs. Gen SSC5D: scavenger receptor cysteine rich family member with 5 domains [Internet]. [citado 17 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/ssc5d

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