Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

SHROOM2

shroom family member 2

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
Xp22.2
Koordinaadid
Kromosoom X: 9 786 429–9 949 443 (GRCh38)
Eksonid
10 eksonit, ulatus 163 kb
Valk
1616 aminohapet
Varasemad tähised
APXL
MANE Select transkript
ENST00000380913.8NM_001649.4
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SHROOM2 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SHROOM2 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom X, millel on sulg kohal, kus asub SHROOM2. SHROOM2 ja sellele lähedal asuvad 6 geeni kromosoomil X, vahemikus 9 367 936 kuni 10 367 935.Kromosoom XXp22.2p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q289,4 Mb9,6 Mb9,8 Mb10 Mb10,2 MbTBL1X: 9 463 258–9 741 723, otsene ahelTBL1XGPR143: 9 724 039–9 786 297, pöördne ahelGPR143SHROOM2: 9 786 429–9 949 443, otsene ahelSHROOM2: 9 786 429–9 968 352, otsene ahelCLDN34: 9 961 424–9 968 352, otsene ahelCLDN34WWC3: 10 015 254–10 144 592, otsene ahelWWC3CLCN4: 10 156 938–10 237 663, otsene ahelCLCN4SHROOM2 skeem: 10 eksonit kromosoomi X otsene ahelalEkson 4: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 9 786 429–9 786 710, 282 alustEkson 2: 9 873 652–9 873 803, 152 alustEkson 3: 9 890 977–9 891 108, 132 alustEkson 4: 9 894 358–9 896 698, 2341 alustEkson 5: 9 898 190–9 898 290, 101 alustEkson 6: 9 932 175–9 932 870, 696 alustEkson 7: 9 937 134–9 937 685, 552 alustEkson 8: 9 939 195–9 939 366, 172 alustEkson 9: 9 944 641–9 944 913, 273 alustEkson 10: 9 946 671–9 949 443, 2773 alust12468105′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 7,5 kb kogupikkusega 163 kb; neist 4851 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse SHROOM2

1

koht geenis SHROOM2, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni SHROOM2 163 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (7,5 kb).

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SHROOM2 geen: shroom family member 2. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/shroom2

Vancouver

Dante Labs. SHROOM2 geen: shroom family member 2 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/shroom2

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test