Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

SHROOM2

shroom family member 2

Sammanfattning

Cytogenetisk position
Xp22.2
Koordinater
Kromosom X: 9 786 429–9 949 443 (GRCh38)
Exoner
10 exoner på 163 kb
Protein
1 616 aminosyror
Tidigare symboler
APXL
MANE Select-transkript
ENST00000380913.8NM_001649.4
Lokustyp
Protein-coding
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser SHROOM2 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är SHROOM2 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Kända sjukdomsorsakande ställen
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom X, med en parentes där SHROOM2 finns. SHROOM2 och 6 gener i närheten på kromosom X, från 9 367 936 till 10 367 935.Kromosom XXp22.2p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q289,4 Mb9,6 Mb9,8 Mb10 Mb10,2 MbTBL1X: 9 463 258–9 741 723, framåt-strängTBL1XGPR143: 9 724 039–9 786 297, bakåt-strängGPR143SHROOM2: 9 786 429–9 949 443, framåt-strängSHROOM2: 9 786 429–9 968 352, framåt-strängCLDN34: 9 961 424–9 968 352, framåt-strängCLDN34WWC3: 10 015 254–10 144 592, framåt-strängWWC3CLCN4: 10 156 938–10 237 663, framåt-strängCLCN4Diagram över SHROOM2: 10 exoner på framåt-strängen av kromosom XExon 4: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 1: 9 786 429–9 786 710, 282 baserExon 2: 9 873 652–9 873 803, 152 baserExon 3: 9 890 977–9 891 108, 132 baserExon 4: 9 894 358–9 896 698, 2 341 baserExon 5: 9 898 190–9 898 290, 101 baserExon 6: 9 932 175–9 932 870, 696 baserExon 7: 9 937 134–9 937 685, 552 baserExon 8: 9 939 195–9 939 366, 172 baserExon 9: 9 944 641–9 944 913, 273 baserExon 10: 9 946 671–9 949 443, 2 773 baser12468105′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 7,5 kb av genens 163 kb, och 4 851 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av SHROOM2

1

position i SHROOM2 där ClinVar klassificerar en förändring som patogen eller sannolikt patogen

Ingen av dem ligger i en region som korta läsningar har svårt att täcka.

En helgenomsekvensering täcker alla 163 kb av SHROOM2, inklusive introner, och inte bara de 7,5 kb exoner.

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
  • Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). SHROOM2-genen: shroom family member 2. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/shroom2

Vancouver

Dante Labs. SHROOM2-genen: shroom family member 2 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/shroom2

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test