Aller au contenu
Utilisez vos fonds HSA ou FSA
Séquencez votre génome (s’ouvre dans un nouvel onglet)

Gène

SHROOM2

shroom family member 2

Résumé

Localisation cytogénétique
Xp22.2
Coordonnées
Chromosome X : 9 786 429–9 949 443 (GRCh38)
Exons
10 exons sur 163 kb
Protéine
1 616 acides aminés
Symboles précédents
APXL
Transcrit MANE Select
ENST00000380913.8NM_001649.4
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SHROOM2. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SHROOM2

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome X, avec un crochet à l'emplacement de SHROOM2. SHROOM2 et 6 gènes à proximité sur le chromosome X, de 9 367 936 à 10 367 935.Chromosome XXp22.2p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q289,4 Mb9,6 Mb9,8 Mb10 Mb10,2 MbTBL1X : 9 463 258–9 741 723, brin directTBL1XGPR143 : 9 724 039–9 786 297, brin inverseGPR143SHROOM2 : 9 786 429–9 949 443, brin directSHROOM2 : 9 786 429–9 968 352, brin directCLDN34 : 9 961 424–9 968 352, brin directCLDN34WWC3 : 10 015 254–10 144 592, brin directWWC3CLCN4 : 10 156 938–10 237 663, brin directCLCN4Schéma de SHROOM2 : 10 exons sur le brin direct du chromosome XExon 4 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 9 786 429–9 786 710, 282 basesExon 2 : 9 873 652–9 873 803, 152 basesExon 3 : 9 890 977–9 891 108, 132 basesExon 4 : 9 894 358–9 896 698, 2 341 basesExon 5 : 9 898 190–9 898 290, 101 basesExon 6 : 9 932 175–9 932 870, 696 basesExon 7 : 9 937 134–9 937 685, 552 basesExon 8 : 9 939 195–9 939 366, 172 basesExon 9 : 9 944 641–9 944 913, 273 basesExon 10 : 9 946 671–9 949 443, 2 773 bases12468105′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 7,5 kb sur les 163 kb du gène ; 4 851 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de SHROOM2

1

position de SHROOM2 où ClinVar classe une variante comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 163 kb de SHROOM2, introns compris, et pas seulement les 7,5 kb d'exons.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • Version des données 2026.10.17-8666dff2.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SHROOM2 : shroom family member 2. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/shroom2

Vancouver

Dante Labs. Gène SHROOM2 : shroom family member 2 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/shroom2

Un seul test. Des réponses pour toute la vie.

À partir de 449 $Livraison gratuite · Résultats sous 6 à 8 semaines

Obtenir mon Genome Test