Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

LGI3

leucine rich repeat LGI family member 3

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
8p21.3
Koordinaadid
Kromosoom 8: 22 146 830–22 156 806 (GRCh38)
Eksonid
8 eksonit, ulatus 10 kb
Valk
548 aminohapet
MANE Select transkript
ENST00000306317.7NM_139278.4
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni LGI3 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas LGI3 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 8, millel on sulg kohal, kus asub LGI3. LGI3 ja sellele lähedal asuvad 24 geeni kromosoomil 8, vahemikus 21 651 818 kuni 22 651 817.Kromosoom 88p21.3p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.321,8 Mb22 Mb22,2 Mb22,4 Mb22,6 MbGFRA2: 21 690 398–21 812 370, pöördne ahelGFRA2DOK2: 21 907 461–21 913 960, pöördne ahelDOK2XPO7: 21 919 545–22 006 585, otsene ahelXPO7NPM2: 22 024 081–22 036 897, otsene ahelNPM2FGF17: 22 042 388–22 048 809, otsene ahelFGF17DMTN: 22 048 995–22 082 527, otsene ahelDMTNFHIP2B: 22 089 139–22 104 911, otsene ahelFHIP2BNUDT18: 22 101 008–22 109 444, pöördne ahelHR: 22 114 042–22 133 393, pöördne ahelHRURF: 22 130 458–22 131 010, pöördne ahelHRURFREEP4: 22 138 007–22 141 951, pöördne ahelREEP4LGI3: 22 146 830–22 156 806, pöördne ahelLGI3SFTPC: 22 156 913–22 164 479, otsene ahelSFTPCBMP1: 22 164 899–22 212 326, otsene ahelBMP1PHYHIP: 22 219 703–22 232 376, pöördne ahelPHYHIPPOLR3D: 22 245 078–22 254 601, otsene ahelPOLR3DPIWIL2: 22 275 310–22 358 580, otsene ahelPIWIL2SLC39A14: 22 366 727–22 434 129, otsene ahelSLC39A14PPP3CC: 22 440 746–22 544 727, otsene ahelPPP3CCSORBS3: 22 544 986–22 575 788, otsene ahelSORBS3PDLIM2: 22 578 058–22 598 025, otsene ahelPDLIM2: 22 589 274–22 602 084, otsene ahelC8orf58: 22 599 588–22 604 271, otsene ahelC8orf58CCAR2: 22 604 629–22 620 964, otsene ahelBIN3: 22 610 290–22 669 148, pöördne ahelLGI3 skeem: 8 eksonit kromosoomi 8 pöördne ahelalEkson 6: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 8: 22 146 830–22 148 977, 2148 alustEkson 7: 22 151 489–22 151 653, 165 alustEkson 6: 22 151 831–22 152 000, 170 alustEkson 5: 22 153 968–22 154 039, 72 alustEkson 4: 22 154 142–22 154 213, 72 alustEkson 3: 22 154 560–22 154 631, 72 alustEkson 2: 22 155 392–22 155 463, 72 alustEkson 1: 22 156 337–22 156 806, 470 alust876543215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 3,2 kb kogupikkusega 10 kb; neist 1647 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse LGI3

3

kohad geenis LGI3, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni LGI3 10 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (3,2 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). LGI3 geen: leucine rich repeat LGI family member 3. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/lgi3

Vancouver

Dante Labs. LGI3 geen: leucine rich repeat LGI family member 3 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/lgi3

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test