Aller au contenu
Utilisez vos fonds HSA ou FSA

Gène

LGI3

leucine rich repeat LGI family member 3

Résumé

Localisation cytogénétique
8p21.3
Coordonnées
Chromosome 8 : 22 146 830–22 156 806 (GRCh38)
Exons
8 exons sur 10 kb
Protéine
548 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000306317.7NM_139278.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore LGI3. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de LGI3

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 8, avec un crochet à l'emplacement de LGI3. LGI3 et 24 gènes à proximité sur le chromosome 8, de 21 651 818 à 22 651 817.Chromosome 88p21.3p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.321,8 Mb22 Mb22,2 Mb22,4 Mb22,6 MbGFRA2 : 21 690 398–21 812 370, brin inverseGFRA2DOK2 : 21 907 461–21 913 960, brin inverseDOK2XPO7 : 21 919 545–22 006 585, brin directXPO7NPM2 : 22 024 081–22 036 897, brin directNPM2FGF17 : 22 042 388–22 048 809, brin directFGF17DMTN : 22 048 995–22 082 527, brin directDMTNFHIP2B : 22 089 139–22 104 911, brin directFHIP2BNUDT18 : 22 101 008–22 109 444, brin inverseHR : 22 114 042–22 133 393, brin inverseHRURF : 22 130 458–22 131 010, brin inverseHRURFREEP4 : 22 138 007–22 141 951, brin inverseREEP4LGI3 : 22 146 830–22 156 806, brin inverseLGI3SFTPC : 22 156 913–22 164 479, brin directSFTPCBMP1 : 22 164 899–22 212 326, brin directBMP1PHYHIP : 22 219 703–22 232 376, brin inversePHYHIPPOLR3D : 22 245 078–22 254 601, brin directPOLR3DPIWIL2 : 22 275 310–22 358 580, brin directPIWIL2SLC39A14 : 22 366 727–22 434 129, brin directSLC39A14PPP3CC : 22 440 746–22 544 727, brin directPPP3CCSORBS3 : 22 544 986–22 575 788, brin directSORBS3PDLIM2 : 22 578 058–22 598 025, brin directPDLIM2 : 22 589 274–22 602 084, brin directC8orf58 : 22 599 588–22 604 271, brin directC8orf58CCAR2 : 22 604 629–22 620 964, brin directBIN3 : 22 610 290–22 669 148, brin inverseSchéma de LGI3 : 8 exons sur le brin inverse du chromosome 8Exon 6 : 1 site connu associé à une maladieExon 8 : 22 146 830–22 148 977, 2 148 basesExon 7 : 22 151 489–22 151 653, 165 basesExon 6 : 22 151 831–22 152 000, 170 basesExon 5 : 22 153 968–22 154 039, 72 basesExon 4 : 22 154 142–22 154 213, 72 basesExon 3 : 22 154 560–22 154 631, 72 basesExon 2 : 22 155 392–22 155 463, 72 basesExon 1 : 22 156 337–22 156 806, 470 bases876543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,2 kb sur les 10 kb du gène ; 1 647 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit LGI3

3

positions dans LGI3 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 10 kb de LGI3, introns compris, et pas seulement les 3,2 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène LGI3 : leucine rich repeat LGI family member 3. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/lgi3

Vancouver

Dante Labs. Gène LGI3 : leucine rich repeat LGI family member 3 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/lgi3

Un seul test. Des réponses pour toute la vie.

À partir de 449 $Livraison gratuite · Résultats sous 6 à 8 semaines

Obtenir mon Genome Test