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Gene

LGI3

leucine rich repeat LGI family member 3

Sintesi

Localizzazione citogenetica
8p21.3
Coordinate
Cromosoma 8: 22.146.830–22.156.806 (GRCh38)
Esoni
8 esoni su 10 kb
Proteina
548 amminoacidi
Trascritto MANE Select
ENST00000306317.7NM_139278.4
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora LGI3. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di LGI3

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 8, con una parentesi dove si trova LGI3. LGI3 e 24 geni nelle vicinanze sul cromosoma 8, da 21.651.818 a 22.651.817.Cromosoma 88p21.3p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.321,8 Mb22 Mb22,2 Mb22,4 Mb22,6 MbGFRA2: 21.690.398–21.812.370, filamento inversoGFRA2DOK2: 21.907.461–21.913.960, filamento inversoDOK2XPO7: 21.919.545–22.006.585, filamento direttoXPO7NPM2: 22.024.081–22.036.897, filamento direttoNPM2FGF17: 22.042.388–22.048.809, filamento direttoFGF17DMTN: 22.048.995–22.082.527, filamento direttoDMTNFHIP2B: 22.089.139–22.104.911, filamento direttoFHIP2BNUDT18: 22.101.008–22.109.444, filamento inversoHR: 22.114.042–22.133.393, filamento inversoHRURF: 22.130.458–22.131.010, filamento inversoHRURFREEP4: 22.138.007–22.141.951, filamento inversoREEP4LGI3: 22.146.830–22.156.806, filamento inversoLGI3SFTPC: 22.156.913–22.164.479, filamento direttoSFTPCBMP1: 22.164.899–22.212.326, filamento direttoBMP1PHYHIP: 22.219.703–22.232.376, filamento inversoPHYHIPPOLR3D: 22.245.078–22.254.601, filamento direttoPOLR3DPIWIL2: 22.275.310–22.358.580, filamento direttoPIWIL2SLC39A14: 22.366.727–22.434.129, filamento direttoSLC39A14PPP3CC: 22.440.746–22.544.727, filamento direttoPPP3CCSORBS3: 22.544.986–22.575.788, filamento direttoSORBS3PDLIM2: 22.578.058–22.598.025, filamento direttoPDLIM2: 22.589.274–22.602.084, filamento direttoC8orf58: 22.599.588–22.604.271, filamento direttoC8orf58CCAR2: 22.604.629–22.620.964, filamento direttoBIN3: 22.610.290–22.669.148, filamento inversoDiagramma di LGI3: 8 esoni sul filamento inverso del cromosoma 8Esone 6: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 8: 22.146.830–22.148.977, 2148 basiEsone 7: 22.151.489–22.151.653, 165 basiEsone 6: 22.151.831–22.152.000, 170 basiEsone 5: 22.153.968–22.154.039, 72 basiEsone 4: 22.154.142–22.154.213, 72 basiEsone 3: 22.154.560–22.154.631, 72 basiEsone 2: 22.155.392–22.155.463, 72 basiEsone 1: 22.156.337–22.156.806, 470 basi876543215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3,2 kb dei 10 kb del gene; 1647 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge LGI3

3

posizioni in LGI3 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 10 kb di LGI3, introni inclusi, non solo i 3,2 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

Cita questa pagina

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Dante Labs. (s.d.). Gene LGI3: leucine rich repeat LGI family member 3. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/lgi3

Vancouver

Dante Labs. Gene LGI3: leucine rich repeat LGI family member 3 [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/lgi3

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