Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

LGI3

leucine rich repeat LGI family member 3

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
8p21.3
Koordinater
Kromosom 8: 22 146 830–22 156 806 (GRCh38)
Eksoner
8 eksoner over 10 kb
Protein
548 aminosyrer
MANE Select-transkripsjon
ENST00000306317.7NM_139278.4
Lokustype
Protein-coding
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser LGI3 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er LGI3 bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 8, med en parentes der LGI3 står. LGI3 og 24 gener i nærheten på kromosom 8, fra 21 651 818 til 22 651 817.Kromosom 88p21.3p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.321,8 Mb22 Mb22,2 Mb22,4 Mb22,6 MbGFRA2: 21 690 398–21 812 370, bakover-strengGFRA2DOK2: 21 907 461–21 913 960, bakover-strengDOK2XPO7: 21 919 545–22 006 585, fremover-strengXPO7NPM2: 22 024 081–22 036 897, fremover-strengNPM2FGF17: 22 042 388–22 048 809, fremover-strengFGF17DMTN: 22 048 995–22 082 527, fremover-strengDMTNFHIP2B: 22 089 139–22 104 911, fremover-strengFHIP2BNUDT18: 22 101 008–22 109 444, bakover-strengHR: 22 114 042–22 133 393, bakover-strengHRURF: 22 130 458–22 131 010, bakover-strengHRURFREEP4: 22 138 007–22 141 951, bakover-strengREEP4LGI3: 22 146 830–22 156 806, bakover-strengLGI3SFTPC: 22 156 913–22 164 479, fremover-strengSFTPCBMP1: 22 164 899–22 212 326, fremover-strengBMP1PHYHIP: 22 219 703–22 232 376, bakover-strengPHYHIPPOLR3D: 22 245 078–22 254 601, fremover-strengPOLR3DPIWIL2: 22 275 310–22 358 580, fremover-strengPIWIL2SLC39A14: 22 366 727–22 434 129, fremover-strengSLC39A14PPP3CC: 22 440 746–22 544 727, fremover-strengPPP3CCSORBS3: 22 544 986–22 575 788, fremover-strengSORBS3PDLIM2: 22 578 058–22 598 025, fremover-strengPDLIM2: 22 589 274–22 602 084, fremover-strengC8orf58: 22 599 588–22 604 271, fremover-strengC8orf58CCAR2: 22 604 629–22 620 964, fremover-strengBIN3: 22 610 290–22 669 148, bakover-strengDiagram av LGI3: 8 eksoner på bakover-strengen til kromosom 8Ekson 6: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 8: 22 146 830–22 148 977, 2 148 baserEkson 7: 22 151 489–22 151 653, 165 baserEkson 6: 22 151 831–22 152 000, 170 baserEkson 5: 22 153 968–22 154 039, 72 baserEkson 4: 22 154 142–22 154 213, 72 baserEkson 3: 22 154 560–22 154 631, 72 baserEkson 2: 22 155 392–22 155 463, 72 baserEkson 1: 22 156 337–22 156 806, 470 baser876543215′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 3,2 kb av genets 10 kb, og 1 647 av disse basene koder for proteinet.

Sekvensering av LGI3

3

posisjoner i LGI3 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen

Ingen av dem ligger i en region som korte leseavlesninger har vanskelig for å dekke.

En helgenomsekvensering dekker alle 10 kb av LGI3, inkludert introner, ikke bare de 3,2 kb med eksoner.

Egenskaper knyttet til LGI3

The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene LGI3 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.

Eksterne lenker

Hvor dette kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
  • ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
  • The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
  • Datautgave 2026.10.17-8666dff2.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). LGI3-genet: leucine rich repeat LGI family member 3. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/lgi3

Vancouver

Dante Labs. LGI3-genet: leucine rich repeat LGI family member 3 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/lgi3

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test