Γονίδιο
MAGT1
magnesium transporter 1
- HGNC 28880↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- Γονίδιο Ensembl ENSG00000102158↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- NCBI Gene 84061↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
Σύνοψη
- Κυτογενετική θέση
- Xq21.1
- Συντεταγμένες
- Χρωμόσωμα X: 77.825.747–77.895.435 (GRCh38)
- Εξόνια
- 10 έξώνια σε 69,7 kb
- Πρωτεΐνη
- 335 αμινοξέα
- Γνωστό επίσης ως
- DKFZp564K142, IAP, OST3B, MRX95, SLC58A1
- Μεταγράφημα MANE Select
- ENST00000618282.5NM_001367916.1
- Τύπος locus
- Κωδικοποιητικά πρωτεΐνες
- Πολύ υψηλή
- Υψηλή
- Χαμηλή
- Πολύ χαμηλή
Αυτή η σελίδα ως δεδομένα
Προσθέστε .json στη διεύθυνση της σελίδας ή ζητήστε application/json, για να τη διαβάσετε ως JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/magt1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameΔιαβάστε το MAGT1, και το υπόλοιπο γονιδίωμά σας, με μία εξέταση.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες
Αποκτήστε το Genome Test σαςΕπιμελημένες αναφορές που σχετίζονται με αυτό το γονίδιο
Λεμφοϋπερπλαστική νόσος συνδεδεμένη με το φύλο και XMEN
- Νόσος XMEN (MAGT1)Υποληπτική, συνδεδεμένη με το X
Χρόνια λοίμωξη από EBV, χαμηλά CD4 κύτταρα, κίνδυνος λεμφώματος και ελλείμματα γλυκοζυλίωσης που προκαλούνται από μεταβολές στο MAGT1.
- Η ClinGen αξιολογεί τη σύνδεση ως οριστική
- 3 υποβολείς του GenCC την αξιολογούν ως οριστική ή ισχυρή
▶Δυνατότητα δράσης
Η διάγνωση καθοδηγεί την παρακολούθηση του EBV και την επιτήρηση για λέμφωμα.
Ευρύτερες ομάδες
Άλλα έμφυτα σφάλματα της ανοσίας
- Ανοσοανεπάρκεια
Ένα από τα 170 γονίδια που συνδέονται με αυτό
Νόσος κατά την οποία υπάρχει ανεπάρκεια ή ελάττωμα στους μηχανισμούς ανοσίας, είτε κυτταρικής είτε χυμικής φύσης.
- Η ClinGen αξιολογεί τη σύνδεση ως οριστική
- 3 υποβολείς του GenCC την αξιολογούν ως οριστική ή ισχυρή
▶Δυνατότητα δράσης
Μεταμόσχευση αιμοποιητικών βλαστικών κυττάρων (HSCT) για SCID και σοβαρές PID· υποκατάσταση ανοσοσφαιρινών (IVIG/SCIG) για ανεπάρκειες αντισωμάτων· λενιολισίμπη (Joenja, FDA 2023) για APDS· γονιδιακή θεραπεία για ADA-SCID· αμπατασέπτη για ανεπάρκεια CTLA4/LRBA· προφυλακτικά αντιβιοτικά· G-CSF για CGD
Πώς είναι διαταγμένο το MAGT1
- Κωδικοποιούσα αλληλουχία
- Μη μεταφραζόμενη περιοχή
- Ιντρόνιο
- Κατεύθυνση μεταγραφής
- Γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο
- Περιοχές που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολες
Εξόνια του μεταγράφηματος MANE Select του γονιδίου (έκδοση v1.5), από τα NCBI και το EMBL-EBI, στο γονιδίωμα αναφοράς GRCh38.
Ζώνες χρωμοσωμάτων από το ιδεόγραμμα GRCh38 του UCSC (2022-10-29).
Γειτονικά γονίδια από την έκδοση 116 του Ensembl, στο GRCh38.
Τα εξόνια αποτελούν 4,5 kb από τα 69,7 kb του γονιδίου· 1.008 από αυτές τις βάσεις κωδικοποιούν την πρωτεΐνη.
Αλληλούχιση MAGT1
1Εύκολο
Πόσο δύσκολο είναι να αλληλουχηθεί το MAGT1 με σύντομες αναγνώσεις, σε κλίμακα από 0 έως 100
0 · Εύκολο100 · Δύσκολο
Σχεδόν όλα τα εξόνια του MAGT1 βρίσκονται σε σημεία όπου οι σύντομες αναγνώσεις αντιστοιχίζονται καθαρά.
Με ό,τι προστίθεται: το ποσοστό των εξονίων του MAGT1 σε κάθε είδος δύσκολης περιοχής
- Δυνατότητα τοποθέτησηςΤμήματα όπου αναγνώσεις 100 ή 250 bp δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά, οπότε μια κλήση εκεί μπορεί να λείπει ή να είναι λανθασμένη. Βάρος 100%.0,1%
- ΟμολογίαΤμηματικές διπλασιάσεις: αντίγραφα αλλού στο γονιδίωμα, όπως παράλογα γονίδια και ψευδογονίδια, με ταυτότητα 90% ή μεγαλύτερη. Βάρος 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Βάρος 60%.0%
- Κάλυψη αναφοράςΚενά στο κοντινό τμήμα του συναρμολογημένου γονιδιώματος αναφοράς, όπου δεν υπάρχει αλληλουχία με την οποία να ευθυγραμμίζονται οι αναγνώσεις. Βάρος 50%.0%
- ΕπαναλήψειςΔιαδοχικές επαναλήψεις και σειρές από μία βάση, πάνω στις οποίες οι αναγνώσεις γλιστρούν και ίσως δεν τις καλύπτουν πλήρως. Βάρος 30%.3,8%
- Περιεκτικότητα σε GCΠαράθυρα με λιγότερο από 25% ή περισσότερο από 65% G και C, τα οποία η προετοιμασία της βιβλιοθήκης καλύπτει ελλιπώς. Βάρος 20%.0,7%
Βαθμολογία της Dante Labs από δική μας έρευνα, βασισμένη στους χάρτες NIST Genome in a Bottle για δύσκολα προς αλληλούχιση περιοχές.Πώς υπολογίζεταιΚάθε μπάρα είναι το ποσοστό των βάσεων των εξονίων του MAGT1 που βρίσκονται σε αυτό το είδος δύσκολης περιοχής. Κάθε μεμονωμένο είδος μπορεί από μόνο του να κάνει ένα γονίδιο δύσκολο, και κάθε επιπλέον είδος προσθέτει λιγότερο: 0 όταν καμία βάση δεν ανήκει σε κάποιο, 100 όταν κάθε βάση βρίσκεται σε περιοχή όπου οι αναγνώσεις δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά.
33
θέσεις στο MAGT1 όπου το ClinVar κατατάσσει μια μεταβολή ως παθογόνες ή πιθανώς παθογόνες
Καμία από αυτές δεν βρίσκεται σε περιοχή που οι σύντομες αναγνώσεις δυσκολεύονται να καλύψουν.
Ένα πλήρες γονιδίωμα καλύπτει και τα 69,7 kb του MAGT1, συμπεριλαμβανομένων των ιντρονίων, και όχι μόνο τα 4,5 kb των εξονίων.
ClinVar pathogenic variants (33)
The MAGT1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Παθογόνο 21
- Πιθανώς παθογόνο 12
| Παραλλαγή | Conditions | Ταξινόμηση ClinVar | Κατάσταση αξιολόγησης |
|---|---|---|---|
| NM_001367916.1(MAGT1):c.616C>T (p.Arg206Ter) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.484dup (p.Ser162fs) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Παθογόνο | ★★★★2 αστέρια από 4 παρέχονται κριτήρια, πολλοί υποβολείς, χωρίς συγκρούσεις |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.972A>C (p.Lys324Asn) (opens in a new tab) | congenital disorder of glycosylation | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.948G>A (p.Trp316Ter) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.909T>A (p.Cys303Ter) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.895C>T (p.Arg299Ter) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia and 1 other | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.842T>G (p.Leu281Ter) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.751_752dup (p.Gly252fs) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.676_680del (p.Phe226fs) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.641_642insGA (p.Phe214fs) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.607_610del (p.Val203fs) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.507G>A (p.Trp169Ter) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.502dup (p.Arg168fs) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.493C>T (p.Gln165Ter) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.490G>T (p.Glu164Ter) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.462T>A (p.Tyr154Ter) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.418del (p.Ile140fs) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.348dup (p.Ala117fs) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.313C>T (p.Arg105Ter) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.272+1G>C (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.127C>T (p.Gln43Ter) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.902-1589_993-77del (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.827-1_838del (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.762+1G>A (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_001367916.1(MAGT1):c.738dup (p.Lys247Ter) (opens in a new tab) | X-linked immunodeficiency with magnesium defect, Epstein-Barr virus infection and neoplasia | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
See all 33 with every other MAGT1 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Γονίδια που σχετίζονται με τις ίδιες παθήσεις
- ADAadenosine deaminaseΜοιράζεται 1 πάθηση
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseΜοιράζεται 1 πάθηση
- AK2adenylate kinase 2Μοιράζεται 1 πάθηση
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1BΜοιράζεται 1 πάθηση
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 5Μοιράζεται 1 πάθηση
- ATMATM serine/threonine kinaseΜοιράζεται 1 πάθηση
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Μοιράζεται 1 πάθηση
- B2Mbeta-2-microglobulinΜοιράζεται 1 πάθηση
- BACH2BACH transcriptional regulator 2Μοιράζεται 1 πάθηση
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorΜοιράζεται 1 πάθηση
- BCL11BBCL11 transcription factor BΜοιράζεται 1 πάθηση
- BLNKB cell linkerΜοιράζεται 1 πάθηση
Χαρακτηριστικά που συνδέονται με το MAGT1
Το Human Phenotype Ontology καταγράφει αυτά ως χαρακτηριστικά των σπάνιων παθήσεων που μπορεί να προκαλέσει το MAGT1. Η σελίδα κάθε χαρακτηριστικού εμφανίζει τα άλλα γονίδια που συνδέονται με αυτό.
Εξωτερικοί σύνδεσμοι
Εγγραφές γονιδίου
Μεταγράφημα
Πρωτεΐνη
Από πού προέρχονται αυτά
- HGNC: το σύμβολο, το όνομα, τα άλλα σύμβολα και η θέση του γονιδίου.
- MANE Select v1.5, από NCBI και EMBL-EBI: το μεταγράφημα, τα εξόνιά του και η κωδικοποιούσα αλληλουχία.
- GenCC και ClinGen, έκδοση 2026-10-19: ποιες παθήσεις συνδέονται με το γονίδιο και πόσο ισχυρή είναι αυτή η σύνδεση.
- Η λίστα δευτερευόντων ευρημάτων του ACMG, SF v3.2.
- ClinVar και οι στρωματοποιήσεις GIAB: γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο, και οι περιοχές που οι βραχείες αναγνώσεις βρίσκουν δύσκολες.
- Οι στρωματοποιήσεις γονιδιώματος Genome in a Bottle, από το NIST: η βαθμολογία δυσκολίας αλληλούχισης.
- Το Human Phenotype Ontology, έκδοση 2026-09-01: τα χαρακτηριστικά που συνδέονται με το γονίδιο. Μάθετε περισσότερα στο hpo.jax.org.
- Έκδοση δεδομένων 2026.10.19-9814e911.
Παραπομπή σε αυτή τη σελίδα
Dante Labs. (χ.η.). Γονίδιο MAGT1: magnesium transporter 1. Ανάκτηση 19 Οκτωβρίου 2026, από https://dantelabs.com/el/genes/magt1
Dante Labs. Γονίδιο MAGT1: magnesium transporter 1 [Internet]. [ανακτήθηκε 19 Οκτωβρίου 2026]. Διαθέσιμο από: https://dantelabs.com/el/genes/magt1
Ένα τεστ. Απαντήσεις για όλη τη ζωή.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες