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Gene

RPUSD1

RNA pseudouridine synthase domain containing 1

Sintesi

Localizzazione citogenetica
16p13.3
Coordinate
Cromosoma 16: 784.974–788.381 (GRCh38)
Esoni
6 esoni su 3,4 kb
Proteina
312 amminoacidi
Noto anche come
RLUCL, MGC19600
Simboli precedenti
C16orf40
Trascritto MANE Select
ENST00000007264.7NM_058192.3
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

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Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora RPUSD1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di RPUSD1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
Cromosoma 16, con una parentesi dove si trova RPUSD1. RPUSD1 e 40 geni nelle vicinanze sul cromosoma 16, da 286.678 a 1.286.677.Cromosoma 1616p13.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.30,4 Mb0,6 Mb0,8 Mb1 Mb1,2 MbPDIA2: 283.152–287.215, filamento direttoPDIA2AXIN1: 287.440–352.734, filamento inversoAXIN1MRPL28: 365.449–371.289, filamento inversoMRPL28PGAP6: 370.779–387.113, filamento inversoPGAP6NME4: 396.725–410.367, filamento direttoNME4DECR2: 401.834–412.492, filamento direttoDECR2RAB11FIP3: 425.593–523.012, filamento direttoRAB11FIP3CAPN15: 527.698–554.636, filamento direttoCAPN15PRR35: 559.688–565.532, filamento direttoPRR35PIGQ: 566.995–584.121, filamento direttoPIGQNHLRC4: 567.000–569.495, filamento direttoNHLRC4RAB40C: 589.007–629.348, filamento direttoRAB40CWFIKKN1: 629.239–634.117, filamento direttoMETTL26: 634.412–636.378, filamento inversoMCRIP2: 636.817–648.475, filamento direttoMCRIP2WDR90: 649.287–667.837, filamento direttoWDR90RHOT2: 668.081–674.174, filamento direttoRHBDL1: 675.605–678.275, filamento direttoSTUB1: 679.980–682.870, filamento direttoJMJD8: 681.666–684.528, filamento inversoJMJD8WDR24: 684.614–690.444, filamento inversoFBXL16: 692.498–705.860, filamento inversoMETRN: 715.093–719.796, filamento direttoMETRNANTKMT: 720.581–722.590, filamento direttoCCDC78: 722.581–726.954, filamento inversoCCDC78HAGHL: 726.494–735.525, filamento direttoCIAO3: 729.721–741.329, filamento inversoCIAO3MSLN: 760.729–768.866, filamento direttoMSLNL: 769.428–782.054, filamento inversoMSLNLRPUSD1: 784.974–788.381, filamento inversoRPUSD1CHTF18: 788.046–800.737, filamento direttoCHTF18GNG13: 798.020–800.770, filamento inversoGNG13LMF1: 853.618–981.318, filamento inversoLMF1SOX8: 981.444–986.979, filamento direttoSOX8SSTR5: 1.063.867–1.081.470, filamento direttoSSTR5C1QTNF8: 1.088.226–1.099.401, filamento inversoC1QTNF8CACNA1H: 1.153.099–1.224.169, filamento direttoCACNA1HTPSG1: 1.221.651–1.225.793, filamento inversoTPSG1TPSB2: 1.227.272–1.233.725, filamento inversoTPSB2TPSAB1: 1.239.266–1.242.555, filamento direttoTPSAB1TPSD1: 1.256.059–1.259.008, filamento direttoTPSD1Diagramma di RPUSD1: 6 esoni sul filamento inverso del cromosoma 16Esone 6: 784.974–786.377, 1404 basiEsone 5: 786.827–786.928, 102 basiEsone 4: 787.077–787.179, 103 basiEsone 3: 787.354–787.477, 124 basiEsone 2: 787.556–787.744, 189 basiEsone 1: 788.256–788.381, 126 basi6543215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 2 kb dei 3,4 kb del gene; 939 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene RPUSD1: RNA pseudouridine synthase domain containing 1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/rpusd1

Vancouver

Dante Labs. Gene RPUSD1: RNA pseudouridine synthase domain containing 1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/rpusd1

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