Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

SLC39A1

solute carrier family 39 member 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
1q21.3
Koordinaadid
Kromosoom 1: 153 959 110–153 963 537 (GRCh38)
Eksonid
4 eksonit, ulatus 4,4 kb
Valk
324 aminohapet
Tuntud ka kui
ZIP1
Varasemad tähised
ZIRTL
MANE Select transkript
ENST00000356205.9NM_001271958.2
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SLC39A1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SLC39A1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
Kromosoom 1, millel on sulg kohal, kus asub SLC39A1. SLC39A1 ja sellele lähedal asuvad 33 geeni kromosoomil 1, vahemikus 153 461 324 kuni 154 461 323.Kromosoom 11q21.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44153,6 Mb153,8 Mb154 Mb154,2 Mb154,4 MbS100A6: 153 532 726–153 536 549, pöördne ahelS100A5: 153 537 147–153 543 074, pöördne ahelS100A5S100A4: 153 543 613–153 552 135, pöördne ahelS100A4S100A3: 153 547 329–153 550 151, pöördne ahelS100A3S100A2: 153 560 950–153 586 676, pöördne ahelS100A2S100A16: 153 606 882–153 614 012, pöördne ahelS100A1: 153 608 923–153 632 044, otsene ahelS100A14: 153 614 255–153 616 996, pöördne ahelS100A13: 153 618 612–153 634 442, pöördne ahelS100A13CHTOP: 153 633 982–153 646 306, otsene ahelCHTOPSNAPIN: 153 658 674–153 663 930, otsene ahelSNAPINILF2: 153 661 746–153 671 028, pöördne ahelILF2NPR1: 153 677 965–153 694 110, otsene ahelNPR1INTS3: 153 728 050–153 774 808, otsene ahelINTS3SLC27A3: 153 774 208–153 780 180, otsene ahelSLC27A3GATAD2B: 153 789 030–153 923 360, pöördne ahelGATAD2BDENND4B: 153 928 862–153 946 749, pöördne ahelCRTC2: 153 947 669–153 958 642, pöördne ahelCRTC2SLC39A1: 153 959 110–153 963 537, pöördne ahelSLC39A1: 153 959 151–153 975 887, pöördne ahelCREB3L4: 153 963 719–153 974 366, otsene ahelCREB3L4JTB: 153 974 269–153 978 011, pöördne ahel: 153 975 850–153 986 246, pöördne ahelRAB13: 153 981 617–153 986 382, pöördne ahelRPS27: 153 990 749–153 992 344, otsene ahelNUP210L: 153 992 690–154 155 116, pöördne ahelTPM3: 154 155 308–154 194 648, pöördne ahelTPM3CFAP141: 154 199 085–154 206 352, pöördne ahelCFAP141LTAP1: 154 206 666–154 220 686, pöördne ahelLTAP1UBAP2L: 154 220 172–154 271 510, otsene ahelUBAP2LHAX1: 154 272 326–154 275 882, otsene ahelHAX1AQP10: 154 321 090–154 325 329, otsene ahelAQP10ATP8B2: 154 325 511–154 351 307, otsene ahelATP8B2IL6R: 154 405 141–154 469 450, otsene ahelIL6RSLC39A1 skeem: 4 eksonit kromosoomi 1 pöördne ahelalEkson 4: 153 959 110–153 960 754, 1645 alustEkson 3: 153 962 220–153 962 350, 131 alustEkson 2: 153 962 529–153 962 747, 219 alustEkson 1: 153 963 495–153 963 537, 43 alust43215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2 kb kogupikkusega 4,4 kb; neist 975 alust kodeerivad valku.

SLC39A1 sekveneerimine

3Lihtne

Kui raske on geeni SLC39A1 lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 0–100

Peaaegu kõik geeni SLC39A1 eksonid asuvad kohtades, kuhu lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Mis sellele lisaks mõjub: geeni SLC39A1 eksonite osakaal igas raskesti loetavas piirkonna liigis

  • Kaardistatavus0%
  • Homoloogia0%
  • Kordused0,8%
  • GC-sisaldus25%
  • Referentsi katvus0%

Dante Labsi enda uuringutel põhinev skoor, mis tugineb NIST-i Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SLC39A1 geen: solute carrier family 39 member 1. Vaadatud 18. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/slc39a1

Vancouver

Dante Labs. SLC39A1 geen: solute carrier family 39 member 1 [Internet]. [viidatud 18. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/slc39a1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test