Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

COLEC11

collectin subfamily member 11

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
2p25.3
Koordinaadid
Kromosoom 2: 3 595 112–3 644 644 (GRCh38)
Eksonid
7 eksonit, ulatus 49,5 kb
Valk
271 aminohapet
Tuntud ka kui
MGC3279, CL-K1, CL-11
MANE Select transkript
ENST00000349077.9NM_024027.5
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni COLEC11 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas COLEC11 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 2, millel on sulg kohal, kus asub COLEC11. COLEC11 ja sellele lähedal asuvad 8 geeni kromosoomil 2, vahemikus 3 119 878 kuni 4 119 877.Kromosoom 22p25.3p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.33,2 Mb3,4 Mb3,6 Mb3,8 Mb4 MbEIPR1: 3 188 255–3 377 879, pöördne ahelEIPR1TRAPPC12: 3 379 669–3 485 094, otsene ahelTRAPPC12ADI1: 3 496 380–3 519 584, pöördne ahelADI1: 3 532 008–3 558 333, pöördne ahelRNASEH1: 3 541 430–3 558 371, pöördne ahelRNASEH1RPS7: 3 575 198–3 580 952, otsene ahelRPS7COLEC11: 3 595 112–3 644 644, otsene ahelCOLEC11ALLC: 3 658 200–3 702 671, otsene ahelALLCDCDC2C: 3 703 575–3 848 008, otsene ahelDCDC2CCOLEC11 skeem: 7 eksonit kromosoomi 2 otsene ahelalEkson 2: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 3 595 112–3 595 168, 57 alustEkson 2: 3 604 315–3 604 470, 156 alustEkson 3: 3 613 311–3 613 382, 72 alustEkson 4: 3 637 533–3 637 604, 72 alustEkson 5: 3 640 278–3 640 331, 54 alustEkson 6: 3 643 444–3 643 539, 96 alustEkson 7: 3 643 727–3 644 644, 918 alust1575′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 1,4 kb kogupikkusega 49,5 kb; neist 816 alust kodeerivad valku.

COLEC11 sekventeerimine

3Madal

Kui raske on COLEC11 lühikeste lugemitega sekventeerida, skaalal 0–100

  • Kaardistatavus0%
  • Homoloogia0%
  • Kordused0,1%
  • GC-sisaldus27%
  • Viitekatvus0%

1

positsioon geenis COLEC11, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Ükski neist ei jää piirkonda, mida lühikesed lugemid raskesti leiavad.

Kogu genoomi sekventeerimine katab kogu COLEC11 49,5 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 1,4 kb eksoneid.

Geeniga COLEC11 seotud tunnused

Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida COLEC11 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB stratifikatsioonid: teadaolevad haigust põhjustavad kohad ja piirkonnad, mida lühikestel lugemistel on raske leida.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljalase 2026.10.17-8666dff2.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). COLEC11 geen: collectin subfamily member 11. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/colec11

Vancouver

Dante Labs. COLEC11 geen: collectin subfamily member 11 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/colec11

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test