Gen
TTC29
tetratricopeptide repeat domain 29
- HGNC 29936↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000137473↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 83894↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 4q31.22
- Koordinatlar
- Kromozom 4: 146.706.617–146.945.864 (GRCh38)
- Eksonlar
- 239,2 kb boyunca 13 ekson
- Protein
- 475 amino asit
- Diğer adları
- NYD-SP14
- MANE Select transkripti
- ENST00000325106.9NM_031956.4
- Lokus türü
- Protein kodlayan
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ttc29.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameTTC29 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili rapor
Erkek İnfertilitesi
Belirli bir süre korunmasız cinsel ilişkiye rağmen erkeğin bir yumurta hücresini döllendirememesi. Erkek steriliteti kalıcı infertilitedir.
- 1 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
TTC29 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 239,2 kb uzunluğunun 2,2 kb'sini oluşturur; bu bazların 1.428 tanesi proteini kodlar.
TTC29 dizilemesi
1Düşük
100 üzerinden, TTC29 genini kısa okumalarla dizilemenin ne kadar zor olduğuHer çubuk, TTC29 geninin ekson bazlarının bu tür zorlu bölgelerdeki payını gösterir. Puan, bunları kısa okuma çağrısına maliyetlerine göre ağırlıklandırır: hiçbir baz herhangi birinde yer almadığında 0, her baz hepsinde yer aldığında 100.
- Eşlenebilirlik100 veya 250 bp'lik okumaların tek anlamlı şekilde yerleştirilemediği bölgeler; bu bölgelerdeki bir çağrı eksik ya da hatalı olabilir. Ağırlık %35.%0
- HomolojiSegmental duplikasyonlar: paralog ve psödogenler gibi genomun başka yerlerindeki, %90 ve üzeri benzerlikteki kopyalar. Ağırlık %30.%0
- TekrarlarOkumaların kaydığı ve kapsayamayabileceği tandem tekrarlar ile tek baz dizileri. Ağırlık %15.%0,9
- GC içeriği%25'in altında veya %65'in üzerinde G ve C oranına sahip pencereler; kütüphane hazırlığının yetersiz kapsadığı alanlar. Ağırlık %10.%10
- Referans kapsamıYakındaki referans dizilimindeki boşluklar; okumaların hizalanacağı bir dizinin bulunmadığı bölgeler. Ağırlık %10.%0
2
ClinVar'ın patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı bir değişikliğin TTC29 içindeki konumları
Bunlardan hiçbiri, kısa okumaların zorlandığı bir bölgeye düşmüyor.
Tüm genom, intronlar dahil, TTC29 genin tamamı olan 239,2 kb'yi kapsar; yalnızca 2,2 kb'lik ekzonları değil.
Aynı durumlarla ilişkili genler
- ACTL9actin like 91 durumu paylaşıyor
- ARMC2armadillo repeat containing 21 durumu paylaşıyor
- AURKCaurora kinase C1 durumu paylaşıyor
- BCORL1BCL6 corepressor like 11 durumu paylaşıyor
- CFAP251cilia and flagella associated protein 2511 durumu paylaşıyor
- CFAP43cilia and flagella associated protein 431 durumu paylaşıyor
- DMC1DNA meiotic recombinase 11 durumu paylaşıyor
- DMRT1doublesex and mab-3 related transcription factor 11 durumu paylaşıyor
- DNAH1dynein axonemal heavy chain 11 durumu paylaşıyor
- DNAH10dynein axonemal heavy chain 101 durumu paylaşıyor
- DNAH12dynein axonemal heavy chain 121 durumu paylaşıyor
- DNAH17dynein axonemal heavy chain 171 durumu paylaşıyor
TTC29 ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, TTC29 geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- 2026-10-17 tarihli GenCC ve ClinGen: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı alanlar.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.17-8666dff2.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). TTC29 geni: tetratricopeptide repeat domain 29. Erişim tarihi: 18 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/ttc29
Dante Labs. TTC29 geni: tetratricopeptide repeat domain 29 [Internet]. [alıntı tarihi 18 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/ttc29
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde