Gén
TTC29
tetratricopeptide repeat domain 29
- HGNC 29936↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000137473↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 83894↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 4q31.22
- Koordináták
- 4. kromoszóma: 146 706 617–146 945 864 (GRCh38)
- Exonok
- 13 exon, összesen 239,2 kb
- Fehérje
- 475 aminosav
- Más néven ismert
- NYD-SP14
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000325106.9NM_031956.4
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ttc29.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a TTC29-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Male Infertility
The inability of the male to effect fertilization of an ovum after a specified period of unprotected intercourse. Male sterility is permanent infertility.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
A TTC29 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 239,2 kb-jából 2,2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1428 bázis kódolja a fehérjét.
TTC29 szekvenálása
1Alacsony
Mennyire nehéz a TTC29 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-bólMinden oszlop azt mutatja, hogy TTC29 exonjainak bázisai közül mekkora rész esik az adott típusú nehezen vizsgálható régióba. A pontszám ezeket az egyes régiók rövid olvasatú vizsgálatra gyakorolt hatása szerint súlyozza: 0, ha egyetlen bázis sem esik egyikbe sem, 100, ha minden bázis mindegyikbe beletartozik.
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így ott a hívás hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 35%.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 30%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket esetleg nem fednek le. Súly: 15%.0,9%
- GC-tartalom25%-nál kevesebb vagy 65%-nál több G és C bázist tartalmazó ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 10%.10%
- Referencia-lefedettségHiányosságok a közeli referenciaszekvenciában, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez a rövid olvasatokat illeszteni lehetne. Súly: 10%.0%
2
a TTC29 génben olyan pozíció, ahol a ClinVar a változást patogénnek vagy valószínűleg patogénnek minősíti
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen találnak meg.
A teljes genom a TTC29 gén mind a 239,2 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az 2,2 kb-nyi exont.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ACTL9actin like 91 betegséget oszt meg
- ARMC2armadillo repeat containing 21 betegséget oszt meg
- AURKCaurora kinase C1 betegséget oszt meg
- BCORL1BCL6 corepressor like 11 betegséget oszt meg
- CFAP251cilia and flagella associated protein 2511 betegséget oszt meg
- CFAP43cilia and flagella associated protein 431 betegséget oszt meg
- DMC1DNA meiotic recombinase 11 betegséget oszt meg
- DMRT1doublesex and mab-3 related transcription factor 11 betegséget oszt meg
- DNAH1dynein axonemal heavy chain 11 betegséget oszt meg
- DNAH10dynein axonemal heavy chain 101 betegséget oszt meg
- DNAH12dynein axonemal heavy chain 121 betegséget oszt meg
- DNAH17dynein axonemal heavy chain 171 betegséget oszt meg
A(z) TTC29 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) TTC29 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-17 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.18-e609d43e.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). TTC29 gén: tetratricopeptide repeat domain 29. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/ttc29
Dante Labs. TTC29 gén: tetratricopeptide repeat domain 29 [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/ttc29
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt