Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

SLC25A21

solute carrier family 25 member 21

Sammanfattning

Cytogenetisk position
14q13.3
Koordinater
Kromosom 14: 36 677 921–37 172 606 (GRCh38)
Exoner
10 exoner på 494,7 kb
Protein
299 aminosyror
Även känd som
ODC1, ODC
MANE Select-transkript
ENST00000331299.6NM_030631.4
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser SLC25A21 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är SLC25A21 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Kända sjukdomsorsakande ställen
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 14, med en parentes där SLC25A21 finns. SLC25A21 och 8 gener i närheten på kromosom 14, från 36 183 235 till 37 667 292.Kromosom 1414q13.3p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.11q32.12q32.13q32.2q32.31q32.32q32.3336,2 Mb36,4 Mb36,6 Mb36,8 Mb37 Mb37,2 Mb37,4 Mb37,6 MbMBIP: 36 298 231–36 320 680, bakåt-strängMBIPSFTA3: 36 473 207–36 521 149, bakåt-strängSFTA3NKX2-1: 36 516 392–36 521 149, bakåt-strängNKX2-1NKX2-8: 36 580 004–36 582 614, bakåt-strängNKX2-8PAX9: 36 657 568–36 679 362, framåt-strängPAX9SLC25A21: 36 677 921–37 172 606, bakåt-strängSLC25A21MIPOL1: 37 197 881–37 580 252, framåt-strängMIPOL1FOXA1: 37 468 435–37 596 059, bakåt-strängFOXA1TTC6: 37 595 382–38 041 442, framåt-strängTTC6Diagram över SLC25A21: 10 exoner på bakåt-strängen av kromosom 14Exon 7: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 10: 36 677 921–36 680 719, 2 799 baserExon 9: 36 683 828–36 683 880, 53 baserExon 8: 36 684 744–36 684 925, 182 baserExon 7: 36 711 318–36 711 482, 165 baserExon 6: 36 725 570–36 725 677, 108 baserExon 5: 36 729 507–36 729 566, 60 baserExon 4: 36 734 507–36 734 573, 67 baserExon 3: 36 813 918–36 814 001, 84 baserExon 2: 36 874 956–36 875 004, 49 baserExon 1: 37 172 281–37 172 606, 326 baser10515′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 3,9 kb av genens 494,7 kb, och 900 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av SLC25A21

6Lätt

Hur svår SLC25A21 är att sekvensera med korta läsningar, av 100

Nästan alla exoner i SLC25A21 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.

Det som tillkommer: andelen av SLC25A21s exoner i varje typ av svår region

  • Kartläggbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Delas med chrY0 %
  • Referenstäckning0 %
  • Repetitioner2,8 %
  • GC-innehåll28 %

Ett Dante Labs-poäng från egen forskning, baserat på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade regioner.Så poängsätts det

1

position i SLC25A21 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen

Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.

Ett helgenomsprov täcker alla 494,7 kb av SLC25A21, inklusive introner, och inte bara de 3,9 kb exoner.

ClinVar-patogena varianter (1)

De SLC25A21-varianter som ClinVar klassificerar som patogena eller sannolikt patogena för något tillstånd, granskade av minst en inlämnare med angivna kriterier, samt de mest granskade av dem. Det är ClinVars offentliga register över genen, aldrig ett resultat.

  • Patogen 1
VariantTillståndClinVar-klassificeringGranskningsstatus
NM_030631.4(SLC25A21):c.532C>T (p.Arg178Ter) (öppnas i en ny flik)mitochondrial DNA depletion syndrome 18Patogen1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare

Egenskaper kopplade till SLC25A21

Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SLC25A21 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
  • Dataversion 2026.10.19-9814e911.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). SLC25A21-genen: solute carrier family 25 member 21. Hämtad 21 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/slc25a21

Vancouver

Dante Labs. SLC25A21-genen: solute carrier family 25 member 21 [Internet]. [citerad 21 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/slc25a21

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test