Gen
ATAD1
ATPase family AAA domain containing 1
- HGNC 25903↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000138138↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 84896↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 10q23.31
- Koordinater
- Kromosom 10: 87 751 512–87 818 226 (GRCh38)
- Exoner
- 10 exoner på 66,7 kb
- Protein
- 361 aminosyror
- Även känd som
- FLJ14600, Msp1
- MANE Select-transkript
- ENST00000680024.1NM_001321967.2
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/atad1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs ATAD1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser ATAD1 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är ATAD1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 4,3 kb av genens 66,7 kb, och 1 086 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av ATAD1
2
positioner i ATAD1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller trolig patogen
1 av dem (50 %) ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
- Segmental duplicationsCopies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy. (1 ställe)
En helgenomsekvensering täcker alla 66,7 kb av ATAD1, inklusive introner, inte bara de 4,3 kb exoner.
ClinVar pathogenic variants (2)
The ATAD1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 1
- Sannolikt patogen 1
| Variant | Conditions | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_001321967.2(ATAD1):c.826G>T (p.Glu276Ter) (opens in a new tab) | hyperekplexia 4 | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_001321967.2(ATAD1):c.1070_1071del (p.His357fs) (opens in a new tab) | hyperekplexia 4 | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
Egenskaper kopplade till ATAD1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som ATAD1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Abnormality of movement
- Ataxia
- Increased reflexes
- Jerking
- Muscle twitch
- Abnormal gait
- Difficulty sleeping
Visa ytterligare 5 egenskaper
Abnormality of the musculoskeletal system
- Spasticity and rigidity of muscles
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Joint stiffness
- Muscle stiffness
- Rigidity
- Hernia
- Joint dislocation
- Distal arthrogryposis
Visa ytterligare 3 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.18-8b139e39.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). ATAD1-genen: ATPase family AAA domain containing 1. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/atad1
Dante Labs. ATAD1-genen: ATPase family AAA domain containing 1 [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/atad1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor