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Gene

PAXX

PAXX non-homologous end joining factor

Resumo

Localização citogenética
9q34.3
Coordenadas
Cromossoma 9: 136 992 422–136 993 976 (GRCh38)
Exões
7 exões ao longo de 1,6 kb
Proteína
204 aminoácidos
Também conhecido como
XLS
Símbolos anteriores
C9orf142
Transcrito MANE Select
ENST00000371620.4NM_183241.3
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa PAXX ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como PAXX está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
Cromossoma 9, com um parêntese onde se situa PAXX. PAXX e 59 genes próximos no cromossoma 9, de 136 493 199 a 137 493 198.Cromossoma 99q34.3p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.3136,6 Mb136,8 Mb137 Mb137,2 Mb137,4 MbNOTCH1: 136 494 433–136 546 048, fita inversaNOTCH1EGFL7: 136 658 284–136 672 684, fita diretaEGFL7AGPAT2: 136 673 142–136 687 483, fita inversaAGPAT2DIPK1B: 136 712 302–136 724 742, fita direta: 136 738 167–136 748 453, fita inversaLCN10: 136 738 167–136 743 356, fita inversaLCN6: 136 744 017–136 748 531, fita inversaLCN6LCN8: 136 754 386–136 758 543, fita inversaLCN8LCN15: 136 759 634–136 766 255, fita inversaLCN15TMEM141: 136 791 303–136 793 317, fita direta: 136 791 379–136 800 595, fita diretaCCDC183: 136 796 338–136 807 741, fita diretaRABL6: 136 807 848–136 841 187, fita diretaAJM1: 136 842 478–136 848 801, fita diretaAJM1PHPT1: 136 847 994–136 851 043, fita diretaPHPT1MAMDC4: 136 850 943–136 860 802, fita diretaMAMDC4EDF1: 136 862 113–136 866 343, fita inversaEDF1TRAF2: 136 881 903–136 929 221, fita diretaTRAF2FBXW5: 136 938 431–136 950 122, fita inversaC8G: 136 942 532–136 946 980, fita diretaC8GLCN12: 136 949 391–136 956 535, fita diretaPTGDS: 136 975 053–136 981 750, fita direta: 136 977 518–136 985 435, fita diretaLCNL1: 136 981 904–136 986 410, fita diretaLCNL1PAXX: 136 992 422–136 993 976, fita diretaPAXXCLIC3: 136 994 608–136 996 729, fita inversaCLIC3ABCA2: 137 007 226–137 028 915, fita inversaABCA2FUT7: 137 030 174–137 032 825, fita inversa: 137 031 241–137 040 436, fita inversaNPDC1: 137 037 577–137 046 700, fita inversaNPDC1ENTPD2: 137 048 107–137 054 069, fita inversaSAPCD2: 137 062 127–137 070 593, fita inversaUAP1L1: 137 077 470–137 084 544, fita diretaUAP1L1MAN1B1: 137 085 917–137 109 189, fita diretaMAN1B1DPP7: 137 110 540–137 118 309, fita inversaDPP7GRIN1: 137 138 346–137 168 765, fita diretaGRIN1LRRC26: 137 168 758–137 170 058, fita inversaLRRC26: 137 168 854–137 171 984, fita inversaTMEM210: 137 170 858–137 172 056, fita inversaTMEM210ANAPC2: 137 174 784–137 189 028, fita inversaSSNA1: 137 188 640–137 190 371, fita diretaTPRN: 137 191 617–137 204 193, fita inversaTMEM203: 137 204 082–137 205 648, fita inversaNDOR1: 137 205 662–137 219 371, fita diretaRNF229: 137 217 494–137 219 361, fita diretaRNF208: 137 219 577–137 222 312, fita inversaCYSRT1: 137 225 174–137 226 315, fita diretaRNF224: 137 226 908–137 229 640, fita diretaRNF224SLC34A3: 137 230 757–137 236 555, fita diretaTUBB4B: 137 241 278–137 243 713, fita diretaTUBB4BCIMIP2A: 137 243 584–137 247 770, fita inversaSTPG3: 137 250 608–137 253 483, fita diretaNELFB: 137 255 210–137 273 542, fita diretaNELFBTOR4A: 137 274 854–137 282 641, fita diretaNRARP: 137 299 631–137 302 271, fita inversaNRARPEXD3: 137 306 894–137 423 911, fita inversaEXD3NOXA1: 137 422 752–137 434 451, fita diretaNOXA1ENTPD8: 137 434 362–137 441 881, fita inversaENTPD8NSMF: 137 447 570–137 459 576, fita inversaNSMFPNPLA7: 137 459 952–137 550 560, fita inversaPNPLA7Diagrama de PAXX: 7 exões na cadeia direta do cromossoma 9Exão 1: 136 992 422–136 992 562, 141 basesExão 2: 136 992 640–136 992 700, 61 basesExão 3: 136 992 925–136 992 974, 50 basesExão 4: 136 993 053–136 993 243, 191 basesExão 5: 136 993 343–136 993 411, 69 basesExão 6: 136 993 580–136 993 664, 85 basesExão 7: 136 993 766–136 993 976, 211 bases12345675′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 0,8 kb dos 1,6 kb do gene; 615 dessas bases codificam a proteína.

Sequenciação de PAXX

19Moderado

Grau de dificuldade de sequenciar PAXX com leituras curtas, numa escala de 0 a 100

Alguns dos exões de PAXX se situam em zonas onde as leituras curtas podem falhar ou posicionar mal uma alteração.

O que acresce: a proporção dos exões de PAXX em cada tipo de região difícil

  • Mapeabilidade0%
  • Homologia0%
  • Partilhado com o chrY0%
  • Cobertura da referência0%
  • Repetições10%
  • Conteúdo em GC80%

Uma pontuação da Dante Labs baseada na nossa própria investigação, construída a partir dos mapas de regiões difíceis de sequenciar Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuação

Ligações externas

De onde vem isto

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene PAXX: PAXX non-homologous end joining factor. Consultado em 21 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/paxx

Vancouver

Dante Labs. Gene PAXX: PAXX non-homologous end joining factor [Internet]. [consultado em 21 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/paxx

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