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Gene

HABP2

hyaluronan binding protein 2

Resumo

Localização citogenética
10q25.3
Coordenadas
Cromossoma 10: 113 553 053–113 589 602 (GRCh38)
Exões
13 exões ao longo de 36,6 kb
Proteína
560 aminoácidos
Também conhecido como
HABP, PHBP, HGFAL, FSAP
Transcrito MANE Select
ENST00000351270.4NM_004132.5
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa HABP2 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como HABP2 está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 10, com um parêntese onde se situa HABP2. HABP2 e 7 genes próximos no cromossoma 10, de 113 071 328 a 114 071 327.Cromossoma 1010q25.3p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.3113,2 Mb113,4 Mb113,6 Mb113,8 Mb114 MbTCF7L2: 112 950 015–113 167 678, fita diretaTCF7L2HABP2: 113 553 053–113 589 602, fita diretaHABP2NRAP: 113 588 714–113 664 121, fita inversaNRAPCASP7: 113 679 158–113 731 668, fita diretaCASP7PLEKHS1: 113 751 262–113 783 429, fita diretaPLEKHS1DCLRE1A: 113 834 725–113 854 417, fita inversaDCLRE1ANHLRC2: 113 854 475–113 917 194, fita diretaNHLRC2ADRB1: 114 043 866–114 046 904, fita diretaADRB1Diagrama de HABP2: 13 exões na cadeia direta do cromossoma 10Exão 1: 113 553 053–113 553 190, 138 basesExão 2: 113 567 489–113 567 525, 37 basesExão 3: 113 574 289–113 574 405, 117 basesExão 4: 113 575 897–113 576 004, 108 basesExão 5: 113 577 150–113 577 266, 117 basesExão 6: 113 578 026–113 578 145, 120 basesExão 7: 113 578 627–113 578 798, 172 basesExão 8: 113 580 595–113 580 692, 98 basesExão 9: 113 581 876–113 582 131, 256 basesExão 10: 113 583 216–113 583 358, 143 basesExão 11: 113 584 148–113 584 282, 135 basesExão 12: 113 585 793–113 585 938, 146 basesExão 13: 113 588 205–113 589 602, 1398 bases123456789101112135′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 3 kb dos 36,6 kb do gene; 1683 dessas bases codificam a proteína.

Sequenciação de HABP2

1Fácil

Dificuldade de sequenciação de HABP2 com leituras curtas, em 100

Quase todos os exões de HABP2 se situam em zonas onde as leituras curtas se alinham com clareza.

O que acresce: a proporção dos exões de HABP2 em cada tipo de região difícil

  • Mapeabilidade0%
  • Homologia0%
  • Repetições0,7%
  • Conteúdo GC6,2%
  • Cobertura da referência0%

Uma pontuação da Dante Labs, baseada na nossa própria investigação e construída sobre os mapas de regiões de difícil sequenciação Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuação

Características associadas a HABP2

A Human Phenotype Ontology indica estas características como sinais das doenças raras que HABP2 pode causar. A página de cada característica lista os outros genes a ela associados.

Ligações externas

De onde vem isto

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
  • Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene HABP2: hyaluronan binding protein 2. Consultado em 18 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/habp2

Vancouver

Dante Labs. Gene HABP2: hyaluronan binding protein 2 [Internet]. [consultado em 18 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/habp2

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