Gen
HABP2
hyaluronan binding protein 2
- HGNC 4798↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000148702↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 3026↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 10q25.3
- Koordinater
- Kromosom 10: 113 553 053–113 589 602 (GRCh38)
- Exoner
- 13 exoner på 36,6 kb
- Protein
- 560 aminosyror
- Även känd som
- HABP, PHBP, HGFAL, FSAP
- MANE Select-transkript
- ENST00000351270.4NM_004132.5
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/habp2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs HABP2, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser HABP2 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är HABP2 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 3 kb av genens 36,6 kb, och 1 683 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av HABP2
1Låg
Hur svår HABP2 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av HABP2s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.0,7 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.6,2 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
Egenskaper kopplade till HABP2
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som HABP2 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). HABP2-genen: hyaluronan binding protein 2. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/habp2
Dante Labs. HABP2-genen: hyaluronan binding protein 2 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/habp2
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor