Gen
GSDME
gasdermin E
- HGNC 2810↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000105928↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 1687↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 7p15.3
- Coördinaten
- Chromosoom 7: 24.698.355–24.757.464 (GRCh38)
- Exons
- 10 exons over 59,1 kb
- Eiwit
- 496 aminozuren
- Ook bekend als
- ICERE-1
- Eerdere symbolen
- DFNA5
- MANE Select-transcript
- ENST00000645220.1NM_001127453.2
- Type locus
- Protein-coding
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gsdme.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees GSDME en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Gehoorverlies en doofheid
- Autosomaal dominant niet-syndromaal gehoorverliesAutosomaal dominant
Autosomaal dominante vorm van niet-syndromale doofheid.
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Niet-syndromale erfelijke gehoorstoornis
Een van 97 genen die hiermee verband houden
Erfelijk gehoorverlies zonder andere medische kenmerken, inclusief de veelvoorkomende recessieve vormen veroorzaakt door GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC en vele andere genen, evenals dominante, X-gebonden en mitochondriale vormen.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Het kennen van de genetische oorzaak kan helpen bij keuzes rond gehoorondersteuning en cochleaire implantaten, bij de geschiktheid voor deelname aan onderzoeken naar genetherapie (bijvoorbeeld bij OTOF) en bij erfelijkheidsadvies voor familieleden.
Opbouw van GSDME
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 2,3 kb van de 59,1 kb van het gen; 1.491 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van GSDME
5
posities in GSDME waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
Een whole genome dekt alle 59,1 kb van GSDME, inclusief intronen, en niet alleen de 2,3 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ACTG1actin gamma 1Deelt 2 aandoeningen
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11ADeelt 2 aandoeningen
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2Deelt 2 aandoeningen
- CD164CD164 moleculeDeelt 2 aandoeningen
- CEACAM16CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane componentDeelt 2 aandoeningen
- COCHcochlinDeelt 2 aandoeningen
- COL11A1collagen type XI alpha 1 chainDeelt 2 aandoeningen
- COL11A2collagen type XI alpha 2 chainDeelt 2 aandoeningen
- DIAPH1diaphanous related formin 1Deelt 2 aandoeningen
- EYA4EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4Deelt 2 aandoeningen
- GJB2gap junction protein beta 2Deelt 2 aandoeningen
- GJB6gap junction protein beta 6Deelt 2 aandoeningen
Kenmerken gekoppeld aan GSDME
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die GSDME kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-17: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). GSDME-gen: gasdermin E. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/gsdme
Dante Labs. GSDME-gen: gasdermin E [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/gsdme
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken