Genas
L2HGDH
L-2-hydroxyglutarate dehydrogenase
- HGNC 20499↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000087299↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 79944↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 14q21.3
- Koordinatės
- Chromosoma 14: 50 242 434–50 312 229 (GRCh38)
- Eksonai
- 10 eksonų per 69,8 kb
- Baltymas
- 463 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- FLJ12618
- Ankstesni simboliai
- C14orf160
- MANE Select transkriptas
- ENST00000267436.9NM_024884.3
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/l2hgdh.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite L2HGDH ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Nė viena Genome Test ataskaita dar nenuskaito L2HGDH geno. Testas seka visą jūsų genomą, todėl jūsų duomenyse jis vis tiek yra.
Kaip išdėstytas L2HGDH
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 6,1 kb iš 69,8 kb geno; 1 392 šių bazių koduoja baltymą.
Sekoskaita: L2HGDH
6Maža
Kiek sunku sekti L2HGDH trumpaisiais skaitiniais, iš 100Kiekvienas stulpelis rodo L2HGDH egzonų bazių dalį tokio tipo sunkiuose regionuose. Balas juos sveria pagal tai, kiek kiekvienas iš jų apsunkina trumpųjų skaitinių iškvietimą: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokį regioną, 100, kai kiekviena bazė patenka į visus jų.
- Atvaizdavimas į genomąRuožai, kuriuose 100 arba 250 bp skaitinių negali būti vienareikšmiškai įtvirtinti, todėl ten esantis rezultatas gali būti nerastas arba klaidingas. Svoris: 35 %.9,5 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kopijos kituose genomo vietose, pavyzdžiui paralogai ir pseudogenai, kai tapatumas 90 % ar didesnis. Svoris: 30 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido serijos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neapimti. Svoris: 15 %.5,5 %
- GC kiekisLangai, kurių GC kiekis yra mažesnis nei 25 % arba didesnis nei 65 %, ir kuriuos bibliotekos paruošimas apima silpnai. Svoris: 10 %.18 %
- Nuorodinio genomo aprėptisSpragos nuorodinėje sekoje šalia, kur nėra sekos, prie kurios trumpieji skaitiniai galėtų prisijungti. Svoris: 10 %.0 %
40
L2HGDH pozicijos, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba greičiausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai aptinka.
Visas genomo sekoskaita apima visus 69,8 kb geno L2HGDH, įskaitant intronus, o ne tik 6,1 kb eksonų.
Savybės, susijusios su L2HGDH
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti L2HGDH, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.17-8666dff2.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). L2HGDH genas: L-2-hydroxyglutarate dehydrogenase. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/l2hgdh
Dante Labs. L2HGDH genas: L-2-hydroxyglutarate dehydrogenase [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/l2hgdh
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites