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Gene

VANGL2

VANGL planar cell polarity protein 2

Sintesi

Localizzazione citogenetica
1q23.2
Coordinate
Cromosoma 1: 160.400.564–160.428.670 (GRCh38)
Esoni
8 esoni su 28,1 kb
Proteina
521 amminoacidi
Noto anche come
KIAA1215, LTAP, LPP1, STBM, STB1, STBM1, MGC119403, MGC119404
Trascritto MANE Select
ENST00000368061.3NM_020335.3
Tipo di locus
Protein-coding
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora VANGL2. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di VANGL2

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 1, con una parentesi dove si trova VANGL2. VANGL2 e 25 geni nelle vicinanze sul cromosoma 1, da 159.914.617 a 160.914.616.Cromosoma 11q23.2p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44160 Mb160,2 Mb160,4 Mb160,6 Mb160,8 MbTAGLN2: 159.918.106–159.925.546, filamento inversoTAGLN2IGSF9: 159.927.039–159.949.468, filamento inversoIGSF9SLAMF9: 159.951.492–159.954.237, filamento inversoSLAMF9KCNJ10: 159.998.651–160.070.483, filamento inversoKCNJ10PIGM: 160.024.953–160.031.990, filamento inversoPIGMKCNJ9: 160.081.501–160.094.277, filamento direttoKCNJ9IGSF8: 160.091.340–160.101.109, filamento inversoIGSF8ATP1A2: 160.115.755–160.143.605, filamento direttoATP1A2ATP1A4: 160.151.586–160.187.593, filamento direttoATP1A4CASQ1: 160.190.212–160.201.886, filamento direttoCASQ1PEA15: 160.205.328–160.220.335, filamento direttoPEA15DCAF8: 160.214.840–160.263.388, filamento inversoDCAF8: 160.216.800–160.285.130, filamento inversoPEX19: 160.266.229–160.286.348, filamento inversoPEX19COPA: 160.288.580–160.343.566, filamento inversoCOPANCSTN: 160.343.294–160.358.957, filamento direttoNCSTNNHLH1: 160.367.071–160.372.846, filamento direttoNHLH1VANGL2: 160.400.564–160.428.670, filamento direttoVANGL2SLAMF6: 160.484.817–160.523.273, filamento inversoSLAMF6CD84: 160.541.095–160.579.544, filamento inversoCD84SLAMF1: 160.608.100–160.647.056, filamento inversoSLAMF1CD48: 160.678.746–160.711.831, filamento inversoCD48SLAMF7: 160.739.057–160.754.821, filamento direttoSLAMF7LY9: 160.796.071–160.828.601, filamento direttoLY9CD244: 160.829.075–160.862.904, filamento inversoCD244ITLN1: 160.876.539–160.893.012, filamento inversoITLN1Diagramma di VANGL2: 8 esoni sul filamento diretto del cromosoma 1Esone 1: 160.400.564–160.400.869, 306 basiEsone 2: 160.415.648–160.415.908, 261 basiEsone 3: 160.416.062–160.416.182, 121 basiEsone 4: 160.419.002–160.419.609, 608 basiEsone 5: 160.420.411–160.420.547, 137 basiEsone 6: 160.421.052–160.421.187, 136 basiEsone 7: 160.424.052–160.424.283, 232 basiEsone 8: 160.425.118–160.428.670, 3553 basi124685′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 5,4 kb dei 28,1 kb del gene; 1566 di queste basi codificano la proteina.

Tratti collegati a VANGL2

L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che VANGL2 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.

Cita questa pagina

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Dante Labs. (s.d.). Gene VANGL2: VANGL planar cell polarity protein 2. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/vangl2

Vancouver

Dante Labs. Gene VANGL2: VANGL planar cell polarity protein 2 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/vangl2

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