Gén
SERPINI1
serpin family I member 1
- HGNC 8943↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000163536↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 5274↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 3q26.1
- Koordináták
- 3. kromoszóma: 167 735 721–167 825 569 (GRCh38)
- Exonok
- 9 exon, összesen 89,8 kb
- Fehérje
- 410 aminosav
- Korábbi jelölések
- PI12
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000446050.7NM_001122752.2
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/serpini1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a SERPINI1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Epilepsy (Full Panel)
- Epilepsy
A 171 hozzá kapcsolódó gén egyike
A brain disorder characterized by episodes of abnormally increased neuronal discharge resulting in transient episodes of sensory or motor neurological dysfunction, or psychic dysfunction. These episodes may or may not be associated with loss of consciousness or convulsions.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
A SERPINI1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 89,8 kb-jából 1,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1233 bázis kódolja a fehérjét.
SERPINI1 szekvenálása
0Alacsony
Mennyire nehéz a SERPINI1 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-bólMinden oszlop azt mutatja, hogy SERPINI1 exonjainak bázisai közül mekkora rész esik az adott típusú nehezen vizsgálható régióba. A pontszám ezeket az egyes régiók rövid olvasatú vizsgálatra gyakorolt hatása szerint súlyozza: 0, ha egyetlen bázis sem esik egyikbe sem, 100, ha minden bázis mindegyikbe beletartozik.
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így ott a hívás hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 35%.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 30%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket esetleg nem fednek le. Súly: 15%.0%
- GC-tartalom25%-nál kevesebb vagy 65%-nál több G és C bázist tartalmazó ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 10%.2,8%
- Referencia-lefedettségHiányosságok a közeli referenciaszekvenciában, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez a rövid olvasatokat illeszteni lehetne. Súly: 10%.0%
3
a SERPINI1 génben olyan pozíció, ahol a ClinVar a változást patogénnek vagy valószínűleg patogénnek minősíti
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen találnak meg.
A teljes genom a SERPINI1 gén mind a 89,8 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az 1,6 kb-nyi exont.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 11 betegséget oszt meg
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferase1 betegséget oszt meg
- ACTL6Bactin like 6B1 betegséget oszt meg
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 221 betegséget oszt meg
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A11 betegséget oszt meg
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit1 betegséget oszt meg
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 21 betegséget oszt meg
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 91 betegséget oszt meg
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulator1 betegséget oszt meg
- ARXaristaless related homeobox1 betegséget oszt meg
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 21 betegséget oszt meg
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 31 betegséget oszt meg
A(z) SERPINI1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) SERPINI1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). SERPINI1 gén: serpin family I member 1. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/serpini1
Dante Labs. SERPINI1 gén: serpin family I member 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/serpini1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt