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Gène

EIF4A1

eukaryotic translation initiation factor 4A1

Résumé

Localisation cytogénétique
17p13.1
Coordonnées
Chromosome 17 : 7 572 825–7 579 006 (GRCh38)
Exons
11 exons sur 6,2 kb
Protéine
406 acides aminés
Aussi appelé
DDX2A, EIF-4A
Symboles précédents
EIF4A
Transcrit MANE Select
ENST00000293831.13NM_001416.4
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore EIF4A1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de EIF4A1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 17, avec un crochet à l'emplacement de EIF4A1. EIF4A1 et 66 gènes à proximité sur le chromosome 17, de 7 075 916 à 8 075 915.Chromosome 1717p13.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.37,2 Mb7,4 Mb7,6 Mb7,8 Mb8 MbCLEC10A : 7 074 537–7 081 166, brin inverseCLEC10AASGR2 : 7 100 166–7 116 603, brin inverseASGR2ASGR1 : 7 172 427–7 179 666, brin inverseASGR1DLG4 : 7 187 187–7 219 836, brin inverseDLG4ACADVL : 7 217 125–7 225 273, brin directDVL2 : 7 225 338–7 234 538, brin inversePHF23 : 7 235 029–7 239 722, brin inverseGABARAP : 7 240 008–7 242 486, brin inverse : 7 240 427–7 244 635, brin inverseCTDNEP1 : 7 243 583–7 252 841, brin inverse : 7 246 829–7 262 089, brin inverseELP5 : 7 250 818–7 260 165, brin directELP5CLDN7 : 7 257 359–7 264 016, brin inverseCLDN7SLC2A4 : 7 281 664–7 289 241, brin directYBX2 : 7 288 253–7 294 750, brin inverseYBX2EIF5A : 7 306 944–7 312 506, brin directGPS2 : 7 309 470–7 315 564, brin inverse : 7 312 661–7 319 174, brin inverseNEURL4 : 7 315 628–7 329 393, brin inverseNEURL4ACAP1 : 7 332 960–7 351 478, brin directKCTD11 : 7 351 889–7 354 944, brin directKCTD11TMEM95 : 7 355 123–7 357 219, brin directTMEM95TNK1 : 7 380 534–7 389 779, brin directTNK1PLSCR3 : 7 389 727–7 397 054, brin inversePLSCR3TMEM256-PLSCR3 : 7 389 734–7 404 097, brin inverseTMEM256 : 7 402 774–7 404 138, brin inverseNLGN2 : 7 404 684–7 419 860, brin directSPEM1 : 7 420 323–7 421 637, brin directSPEM2 : 7 425 563–7 427 568, brin directSPEM3 : 7 428 857–7 432 820, brin direct : 7 428 861–7 436 278, brin directTMEM102 : 7 435 344–7 437 679, brin directFGF11 : 7 438 128–7 444 937, brin directFGF11CHRNB1 : 7 445 004–7 457 710, brin directCHRNB1ZBTB4 : 7 459 366–7 484 278, brin inverseZBTB4SLC35G6 : 7 481 446–7 483 496, brin directSLC35G6POLR2A : 7 484 366–7 514 616, brin directPOLR2ATNFSF12 : 7 548 508–7 557 890, brin directTNFSF12-TNFSF13 : 7 549 099–7 561 601, brin directTNFSF13 : 7 558 251–7 561 660, brin directSENP3 : 7 561 867–7 571 969, brin directSENP3SENP3-EIF4A1 : 7 563 287–7 578 715, brin directSENP3-EIF4A1EIF4A1 : 7 572 825–7 579 006, brin directEIF4A1CD68 : 7 579 380–7 582 515, brin directCD68MPDU1 : 7 583 214–7 594 419, brin directSOX15 : 7 588 178–7 590 101, brin inverseFXR2 : 7 591 230–7 614 916, brin inverseSHBG : 7 613 946–7 633 469, brin directSAT2 : 7 626 234–7 627 879, brin inverseSAT2ATP1B2 : 7 646 627–7 657 771, brin directATP1B2TP53 : 7 661 779–7 687 546, brin inverseTP53WRAP53 : 7 686 071–7 703 505, brin directWRAP53EFNB3 : 7 705 172–7 711 372, brin directEFNB3DNAH2 : 7 717 728–7 833 742, brin directDNAH2KDM6B : 7 834 193–7 854 808, brin directKDM6BTMEM88 : 7 855 057–7 856 114, brin directTMEM88NAA38 : 7 856 681–7 885 238, brin inverseNAA38CYB5D1 : 7 857 696–7 862 282, brin directCYB5D1CHD3 : 7 884 787–7 912 760, brin directCHD3RNF227 : 7 913 238–7 916 377, brin inverseKCNAB3 : 7 920 956–7 929 856, brin inverseKCNAB3 : 7 925 931–7 930 622, brin inverseTRAPPC1 : 7 930 345–7 932 123, brin inverseTRAPPC1CNTROB : 7 932 101–7 949 953, brin directGUCY2D : 8 002 615–8 020 342, brin directGUCY2DALOX15B : 8 039 011–8 049 134, brin directALOX15BALOX12B : 8 068 594–8 087 716, brin inverseALOX12BSchéma de EIF4A1 : 11 exons sur le brin direct du chromosome 17Exon 1 : 7 572 825–7 572 864, 40 basesExon 2 : 7 574 260–7 574 308, 49 basesExon 3 : 7 574 546–7 574 678, 133 basesExon 4 : 7 575 119–7 575 258, 140 basesExon 5 : 7 576 524–7 576 692, 169 basesExon 6 : 7 577 056–7 577 165, 110 basesExon 7 : 7 577 344–7 577 487, 144 basesExon 8 : 7 577 569–7 577 706, 138 basesExon 9 : 7 577 827–7 577 916, 90 basesExon 10 : 7 578 165–7 578 244, 80 basesExon 11 : 7 578 342–7 579 006, 665 bases12345678910115′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,8 kb sur les 6,2 kb du gène ; 1 221 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de EIF4A1

6Facile

Difficulté de séquençage de EIF4A1 avec des lectures courtes, sur 100

Presque tous les exons de EIF4A1 se situent dans des zones où les lectures courtes s'alignent correctement.

Facteur aggravant : la part des exons de EIF4A1 située dans chaque type de région difficile

  • Mappabilité16 %
  • Homologie0 %
  • Répétitions2,5 %
  • Teneur en GC0,6 %
  • Couverture de référence0 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène EIF4A1 : eukaryotic translation initiation factor 4A1. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/eif4a1

Vancouver

Dante Labs. Gène EIF4A1 : eukaryotic translation initiation factor 4A1 [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/eif4a1

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