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Gène

CCDC78

coiled-coil domain containing 78

Résumé

Localisation cytogénétique
16p13.3
Coordonnées
Chromosome 16 : 722 582–726 443 (GRCh38)
Exons
14 exons sur 3,9 kb
Protéine
470 acides aminés
Aussi appelé
FLJ34512
Symboles précédents
C16orf25
Transcrit MANE Select
ENST00000345165.10NM_001378030.1
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore CCDC78. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de CCDC78

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
Chromosome 16, avec un crochet à l'emplacement de CCDC78. CCDC78 et 41 gènes à proximité sur le chromosome 16, de 224 513 à 1 224 512.Chromosome 1616p13.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.30,4 Mb0,6 Mb0,8 Mb1 Mb1,2 MbLUC7L : 188 943–229 485, brin inverseLUC7LFAM234A : 234 521–272 183, brin directRGS11 : 268 301–275 980, brin inverseRGS11ARHGDIG : 280 386–283 010, brin directARHGDIGPDIA2 : 283 152–287 215, brin directPDIA2AXIN1 : 287 440–352 734, brin inverseAXIN1MRPL28 : 365 449–371 289, brin inverseMRPL28PGAP6 : 370 779–387 113, brin inversePGAP6NME4 : 396 725–410 367, brin directNME4DECR2 : 401 834–412 492, brin directDECR2RAB11FIP3 : 425 593–523 012, brin directRAB11FIP3CAPN15 : 527 698–554 636, brin directCAPN15PRR35 : 559 688–565 532, brin directPRR35PIGQ : 566 995–584 121, brin directPIGQNHLRC4 : 567 000–569 495, brin directNHLRC4RAB40C : 589 007–629 348, brin directWFIKKN1 : 629 239–634 117, brin directMETTL26 : 634 412–636 378, brin inverseMETTL26MCRIP2 : 636 817–648 475, brin directMCRIP2WDR90 : 649 287–667 837, brin directWDR90RHOT2 : 668 081–674 174, brin directRHBDL1 : 675 605–678 275, brin directSTUB1 : 679 980–682 870, brin directJMJD8 : 681 666–684 528, brin inverseWDR24 : 684 614–690 444, brin inverseFBXL16 : 692 498–705 860, brin inverseMETRN : 715 093–719 796, brin directMETRNANTKMT : 720 581–722 590, brin directANTKMTCCDC78 : 722 582–726 443, brin inverseCCDC78HAGHL : 726 494–735 525, brin directHAGHLCIAO3 : 729 721–741 329, brin inverseMSLN : 760 729–768 866, brin directMSLNL : 769 428–782 054, brin inverseMSLNLRPUSD1 : 784 974–788 406, brin inverseRPUSD1CHTF18 : 788 046–800 737, brin directCHTF18GNG13 : 798 020–800 770, brin inverseLMF1 : 853 618–981 318, brin inverseLMF1SOX8 : 981 444–986 979, brin directSOX8SSTR5 : 1 063 867–1 081 470, brin directSSTR5C1QTNF8 : 1 088 226–1 099 401, brin inverseC1QTNF8CACNA1H : 1 153 099–1 224 169, brin directCACNA1HTPSG1 : 1 221 651–1 225 793, brin inverseTPSG1Schéma de CCDC78 : 14 exons sur le brin inverse du chromosome 16Exon 14 : 722 582–722 789, 208 basesExon 13 : 722 922–723 022, 101 basesExon 12 : 723 095–723 161, 67 basesExon 11 : 723 857–723 936, 80 basesExon 10 : 724 106–724 205, 100 basesExon 9 : 724 322–724 509, 188 basesExon 8 : 724 681–724 806, 126 basesExon 7 : 724 911–724 989, 79 basesExon 6 : 725 078–725 145, 68 basesExon 5 : 725 237–725 293, 57 basesExon 4 : 725 413–725 580, 168 basesExon 3 : 725 794–725 880, 87 basesExon 2 : 725 966–726 085, 120 basesExon 1 : 726 308–726 443, 136 bases14131211109876543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,6 kb sur les 3,9 kb du gène ; 1 413 de ces bases codent pour la protéine.

Traits associés à CCDC78

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que CCDC78 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène CCDC78 : coiled-coil domain containing 78. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ccdc78

Vancouver

Dante Labs. Gène CCDC78 : coiled-coil domain containing 78 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ccdc78

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