Geeni
ZMYND8
zinc finger MYND-type containing 8
- HGNC 9397↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000101040↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 23613↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 20q13.12
- Koordinaatit
- Kromosomi 20: 47 209 214–47 356 699 (GRCh38)
- Eksonit
- 23 eksonia 147,5 kb:n alueella
- Proteiini
- 1 234 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- RACK7, KIAA1125
- Aiemmat symbolit
- PRKCBP1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000471951.7NM_001281775.3
- Lokustyyppi
- Proteiinia koodaava
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/zmynd8.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue ZMYND8 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Oireyhtymä, jolle on ominaista neurokehityksen häiriö
Sairausryhmä, jossa kehitysviivettä esiintyy yhdessä aivojen ulkopuolisten oireiden kanssa. Kukin sairaus johtuu yhden geenin muutoksesta. Osa tässä mainituista geeneistä, kuten ANKRD17, ASH1L ja MYT1L, aiheuttaa sairauden, kun yksi kopio muuttuu, yleensä de novo -muutoksena; AFG2A-välitteinen sairaus edellyttää muutoksia molemmissa kopioissa.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 1 GenCC-arvioija pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Kehitykseen, koulunkäyntiin ja terapiaan liittyvää tukea sekä tutkimuksia kohtauksien, kasvun, näön, kuulon ja muiden elinten oireiden varalta geenistä riippuen. Geneettinen neuvonta riippuu geenistä: de novo -dominanttien muutosten kohdalla suositellaan vanhempien testausta ja resessiivisten muotojen kohdalla kantajatestausta.
ZMYND8-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 5,3 kb geenin 147,5 kb:stä; 3 705 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
ZMYND8-geenin sekvensointi
2Helppo
Kuinka vaikea ZMYND8-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100
0 · Helppo100 · Vaikea
Lähes kaikki ZMYND8-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joihin lyhyet lukemat kohdistuvat selvästi.
Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa ZMYND8-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.
- KartoitettavuusKohdat, joissa 100 tai 250 bp:n lukemia ei voi sijoittaa yksiselitteisesti, joten muutos siellä voi puuttua tai olla väärä. Yksinään geeni, joka sijaitsee kokonaan tämäntyyppisellä alueella, saisi pisteet 100.0 %
- HomologiaSegmentaaliset duplikaatit: kopiot muualla genomissa, kuten paralogit ja pseudogeenit, vähintään 90 %:n identiteetillä. Yksinään geeni, joka sijaitsee kokonaan tämäntyyppisellä alueella, saisi pisteet 60.0 %
- Yhteinen chrY:n kanssaPseudoautosomaaliset alueet ja X-transponoitu alue, joissa chrX ja chrY sisältävät saman tai lähes saman sekvenssin, joten toisesta kromosomista luettu lukema voidaan sijoittaa toiseen. Yksinään geeni, joka sijaitsee kokonaan tämäntyyppisellä alueella, saisi pisteet 60.0 %
- Referenssin kattavuusLäheisissä kohdissa referenssikokoonpanossa on aukkoja, joihin lukemat eivät voi kohdistua, koska sekvenssiä ei ole. Yksinään geeni, joka sijaitsee kokonaan tämäntyyppisellä alueella, saisi pisteet 50.0 %
- ToistotTandem-toistot ja yhden emäksen jaksot, joiden kohdalla lukemat luiskahtavat eivätkä välttämättä kata niitä. Yksinään geeni, joka sijaitsee kokonaan tämäntyyppisellä alueella, saisi pisteet 30.4,3 %
- GC-pitoisuusIkkunat, joissa G- ja C-emästen osuus on alle 25 % tai yli 65 %; kirjastovalmistus kattaa ne ohuesti. Yksinään geeni, joka sijaitsee kokonaan tämäntyyppisellä alueella, saisi pisteet 20.3,9 %
Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaanJokainen palkki on sen vaikean aluetyypin osuus ZMYND8-geenin eksonien emäksistä. Mikä tahansa yksittäinen tyyppi voi tehdä geenistä vaikean yksinäänkin, ja jokainen lisätyyppi lisää vähemmän: 0, kun mikään emäs ei ole missään, 100, kun jokainen emäs on kohdassa, johon lukemia ei voi sijoittaa yksiselitteisesti.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- AFG2AAAA ATPase AFG2AYhteinen sairaus: 1
- ANKRD17ankyrin repeat domain 17Yhteinen sairaus: 1
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Yhteinen sairaus: 1
- ASH1LASH1 like histone lysine methyltransferaseYhteinen sairaus: 1
- BRPF1bromodomain and PHD finger containing 1Yhteinen sairaus: 1
- MYT1Lmyelin transcription factor 1 likeYhteinen sairaus: 1
- NFIBnuclear factor I BYhteinen sairaus: 1
- PAN2poly(A) specific ribonuclease subunit PAN2Yhteinen sairaus: 1
- QRICH1glutamine rich 1Yhteinen sairaus: 1
- RNU4-2RNA, U4 small nuclear 2Yhteinen sairaus: 1
- SETD5SET domain containing 5Yhteinen sairaus: 1
- TBCKTBC1 domain containing kinaseYhteinen sairaus: 1
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tiedot ovat peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-19: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.
- Tietojulkaisu 2026.10.19-9814e911.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). ZMYND8-geeni: zinc finger MYND-type containing 8. Haettu 20. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/zmynd8
Dante Labs. ZMYND8-geeni: zinc finger MYND-type containing 8 [Internet]. [viitattu 20. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/zmynd8
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa