Gen
ZMYND8
zinc finger MYND-type containing 8
- HGNC 9397↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000101040↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 23613↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 20q13.12
- Souřadnice
- Chromozom 20: 47 209 214–47 356 699 (GRCh38)
- Exony
- 23 exonů na 147,5 kb
- Protein
- 1 234 aminokyselin
- Další názvy
- RACK7, KIAA1125
- Předchozí symboly
- PRKCBP1
- Transkript MANE Select
- ENST00000471951.7NM_001281775.3
- Typ lokusu
- Kódující proteiny
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/zmynd8.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si ZMYND8 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Syndromic Complex Neurodevelopmental Disorder
A grouping of conditions that share developmental delay with features beyond the brain, each caused by changes in a single gene. Some of the genes here, such as ANKRD17, ASH1L and MYT1L, cause disease when one copy is changed, usually de novo; AFG2A-related disease needs changes in both copies.
- ClinGen hodnotí souvislost jako definitivní
- 1 hodnotitel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
▶Akcionabilita
Developmental, educational and therapy support, with assessment for seizures, growth, vision, hearing and other organ features suggested by the specific gene. Genetic counselling depends on the gene: parental testing for de novo dominant changes, and carrier testing for recessive forms.
Jak je ZMYND8 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 5,3 kb z 147,5 kb genu; 3 705 těchto bází kódují protein.
Sekvenování ZMYND8
2Snadné
Jak obtížné je sekvenovat ZMYND8 krátkými čteními, ze 100
0 · Snadné100 · Obtížné
Téměř všechny exony genu ZMYND8 leží v místech, kde se krátká čtení spolehlivě mapují.
Co k tomu přispívá: podíl exonů genu ZMYND8 v jednotlivých typech obtížných oblastí
- MapovatelnostÚseky, kde nelze čtení o délce 100 nebo 250 bp jednoznačně umístit, takže volání v nich může chybět nebo být chybné. Váha 100 %.0 %
- HomologieSegmentální duplikace: kopie jinde v genomu, například paralogy a pseudogeny, se shodou 90 % nebo více. Váha 60 %.0 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Váha 60 %.0 %
- Pokrytí referenčního genomuMezery v referenční sestavě v okolí, kde není sekvence, na kterou by se čtení mohla zarovnat. Váha 50 %.0 %
- RepeticeTandemové repetice a úseky jedné báze, na kterých čtení sklouzávají a které nemusí přesně pokrýt. Váha 30 %.4,3 %
- Obsah GCOkna s méně než 25 % nebo více než 65 % G a C, která příprava knihovny pokrývá slabě. Váha 20 %.3,9 %
Skóre Dante Labs z vlastního výzkumu, založené na mapách obtížně sekvenovatelných oblastí Genome in a Bottle od NIST.Jak se skóre počítáKaždý sloupec udává podíl bází exonů genu ZMYND8 v daném typu obtížné oblasti. Jeden typ může gen sám o sobě učinit obtížným a každý další přidá méně: 0, pokud žádná báze není v žádném typu, 100, pokud je každá báze tam, kde nelze čtení jednoznačně umístit.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- AFG2AAAA ATPase AFG2ASdílí 1 onemocnění
- ANKRD17ankyrin repeat domain 17Sdílí 1 onemocnění
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Sdílí 1 onemocnění
- ASH1LASH1 like histone lysine methyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- BRPF1bromodomain and PHD finger containing 1Sdílí 1 onemocnění
- MYT1Lmyelin transcription factor 1 likeSdílí 1 onemocnění
- NFIBnuclear factor I BSdílí 1 onemocnění
- PAN2poly(A) specific ribonuclease subunit PAN2Sdílí 1 onemocnění
- QRICH1glutamine rich 1Sdílí 1 onemocnění
- RNU4-2RNA, U4 small nuclear 2Sdílí 1 onemocnění
- SETD5SET domain containing 5Sdílí 1 onemocnění
- TBCKTBC1 domain containing kinaseSdílí 1 onemocnění
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud to pochází
- HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-19: se kterými stavy je gen spojen a jak silně.
- Seznam ACMG pro sekundární nálezy, SF v3.2.
- Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.
- Vydání dat 2026.10.19-9814e911.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen ZMYND8: zinc finger MYND-type containing 8. Staženo 19. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/zmynd8
Dante Labs. Gen ZMYND8: zinc finger MYND-type containing 8 [Internet]. [citováno 19. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/zmynd8
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů