Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

SLC12A4

solute carrier family 12 member 4

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
16q22.1
Koordinaadid
Kromosoom 16: 67 943 474–67 968 637 (GRCh38)
Eksonid
24 eksonit, ulatus 25,2 kb
Valk
1085 aminohapet
Tuntud ka kui
KCC1
MANE Select transkript
ENST00000316341.8NM_005072.5
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SLC12A4 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SLC12A4 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 16, millel on sulg kohal, kus asub SLC12A4. SLC12A4 ja sellele lähedal asuvad 34 geeni kromosoomil 16, vahemikus 67 456 056 kuni 68 456 055.Kromosoom 1616q22.1p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.367,6 Mb67,8 Mb68 Mb68,2 Mb68,4 MbATP6V0D1: 67 437 523–67 481 227, pöördne ahelATP6V0D1AGRP: 67 482 571–67 483 552, pöördne ahelAGRPRIPOR1: 67 518 418–67 546 788, otsene ahelRIPOR1CTCF: 67 561 831–67 639 189, otsene ahelCARMIL2: 67 644 988–67 657 569, otsene ahelACD: 67 657 512–67 660 810, pöördne ahelPARD6A: 67 660 350–67 664 266, otsene ahelPARD6AENKD1: 67 662 945–67 667 954, pöördne ahelENKD1C16orf86: 67 666 802–67 668 757, otsene ahelC16orf86GFOD2: 67 674 527–67 719 352, pöördne ahelGFOD2RANBP10: 67 723 070–67 806 563, pöördne ahelRANBP10TSNAXIP1: 67 806 765–67 832 148, otsene ahelCENPT: 67 828 157–67 847 811, pöördne ahelTHAP11: 67 842 320–67 844 195, otsene ahelTHAP11NUTF2: 67 844 369–67 872 569, otsene ahelNUTF2EDC4: 67 873 049–67 884 520, otsene ahelEDC4NRN1L: 67 884 868–67 888 855, otsene ahelNRN1LPSKH1: 67 893 244–67 929 676, otsene ahelCTRL: 67 927 640–67 932 365, pöördne ahel: 67 929 614–67 936 017, pöördne ahelPSMB10: 67 934 504–67 936 865, pöördne ahelPSMB10LCAT: 67 939 150–67 944 681, pöördne ahelLCATSLC12A4: 67 943 474–67 968 637, pöördne ahelSLC12A4DPEP3: 67 975 661–67 980 554, pöördne ahelDPEP3DPEP2: 67 987 392–68 000 624, pöördne ahelDPEP2DUS2: 67 987 746–68 079 344, otsene ahelDPEP2NB: 68 013 436–68 015 911, pöördne ahelDPEP2NBDDX28: 68 020 916–68 023 232, pöördne ahelDDX28NFATC3: 68 084 751–68 229 259, otsene ahelNFATC3ESRP2: 68 225 974–68 238 102, pöördne ahelESRP2PLA2G15: 68 245 304–68 261 063, otsene ahelPLA2G15SLC7A6: 68 264 173–68 301 853, otsene ahelSLC7A6SLC7A6OS: 68 284 498–68 310 968, pöördne ahelSLC7A6OSPRMT7: 68 310 916–68 360 852, otsene ahelPRMT7SMPD3: 68 358 327–68 448 550, pöördne ahelSMPD3SLC12A4 skeem: 24 eksonit kromosoomi 16 pöördne ahelalEkson 24: 67 943 474–67 944 931, 1458 alustEkson 23: 67 945 087–67 945 220, 134 alustEkson 22: 67 945 369–67 945 553, 185 alustEkson 21: 67 945 764–67 945 871, 108 alustEkson 20: 67 945 951–67 946 082, 132 alustEkson 19: 67 946 171–67 946 340, 170 alustEkson 18: 67 946 438–67 946 633, 196 alustEkson 17: 67 946 937–67 947 105, 169 alustEkson 16: 67 947 331–67 947 435, 105 alustEkson 15: 67 947 669–67 947 788, 120 alustEkson 14: 67 948 061–67 948 159, 99 alustEkson 13: 67 949 800–67 949 918, 119 alustEkson 12: 67 950 319–67 950 493, 175 alustEkson 11: 67 950 654–67 950 711, 58 alustEkson 10: 67 950 962–67 951 060, 99 alustEkson 9: 67 951 140–67 951 304, 165 alustEkson 8: 67 951 823–67 952 037, 215 alustEkson 7: 67 952 184–67 952 425, 242 alustEkson 6: 67 954 643–67 954 773, 131 alustEkson 5: 67 957 742–67 957 796, 55 alustEkson 4: 67 957 898–67 958 044, 147 alustEkson 3: 67 961 575–67 961 706, 132 alustEkson 2: 67 963 465–67 963 559, 95 alustEkson 1: 67 968 439–67 968 637, 199 alust24201510515′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 4,7 kb kogupikkusega 25,2 kb; neist 3258 alust kodeerivad valku.

SLC12A4 sekveneerimine

5Lihtne

Kui raske on geeni SLC12A4 lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 0–100

Peaaegu kõik geeni SLC12A4 eksonid asuvad kohtades, kuhu lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Mis sellele lisaks mõjub: geeni SLC12A4 eksonite osakaal igas raskesti loetavas piirkonna liigis

  • Kaardistatavus0%
  • Homoloogia0%
  • Kordused2,2%
  • GC-sisaldus46%
  • Referentsi katvus0%

Dante Labsi enda uuringutel põhinev skoor, mis tugineb NIST-i Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SLC12A4 geen: solute carrier family 12 member 4. Vaadatud 18. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/slc12a4

Vancouver

Dante Labs. SLC12A4 geen: solute carrier family 12 member 4 [Internet]. [viidatud 18. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/slc12a4

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test