Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

CPSF1

cleavage and polyadenylation specific factor 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
8q24.3
Koordinaadid
Kromosoom 8: 144 393 231–144 409 335 (GRCh38)
Eksonid
38 eksonit, ulatus 16,1 kb
Valk
1443 aminohapet
Tuntud ka kui
CPSF160
MANE Select transkript
ENST00000616140.2NM_013291.3
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni CPSF1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas CPSF1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 8, millel on sulg kohal, kus asub CPSF1. CPSF1 ja sellele lähedal asuvad 47 geeni kromosoomil 8, vahemikus 143 901 283 kuni 144 901 282.Kromosoom 88q24.3p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.3144 Mb144,2 Mb144,4 Mb144,6 Mb144,8 MbPLEC: 143 915 152–143 977 039, pöördne ahelPLECPARP10: 143 977 151–144 019 930, pöördne ahelPARP10GRINA: 143 990 048–143 994 935, otsene ahelGRINASPATC1: 144 012 275–144 047 114, otsene ahelSPATC1OPLAH: 144 051 265–144 064 091, pöördne ahelEXOSC4: 144 078 560–144 081 408, otsene ahel: 144 078 642–144 084 330, otsene ahelGPAA1: 144 082 337–144 093 149, otsene ahelCYC1: 144 095 039–144 097 525, otsene ahelSHARPIN: 144 097 513–144 108 124, pöördne ahelSHARPINMAF1: 144 103 112–144 107 618, otsene ahelMAF1WDR97: 144 107 726–144 118 328, otsene ahelWDR97HGH1: 144 137 774–144 140 851, otsene ahelHGH1MROH1: 144 147 975–144 262 470, otsene ahelMROH1BOP1: 144 262 045–144 291 453, pöördne ahelBOP1SCX: 144 266 446–144 268 481, otsene ahelSCXHSF1: 144 291 521–144 314 729, otsene ahelHSF1DGAT1: 144 314 584–144 326 916, pöördne ahelDGAT1SCRT1: 144 330 565–144 336 503, pöördne ahelSLC52A2: 144 333 957–144 361 447, otsene ahelCATSPERQ: 144 352 219–144 354 954, pöördne ahel: 144 353 228–144 355 609, pöördne ahelFBXL6: 144 355 427–144 359 376, pöördne ahelFBXL6ADCK5: 144 373 101–144 393 243, otsene ahelADCK5CPSF1: 144 393 231–144 409 335, pöördne ahelCPSF1SLC39A4: 144 409 742–144 416 894, pöördne ahelSLC39A4VPS28: 144 423 597–144 429 499, pöördne ahelVPS28TONSL: 144 428 763–144 444 488, pöördne ahelTONSLZFTRAF1: 144 447 345–144 462 908, pöördne ahelTMEM276-ZFTRAF1: 144 449 582–144 465 430, pöördne ahelTMEM276: 144 463 817–144 466 890, pöördne ahelKIFC2: 144 465 940–144 474 202, otsene ahelFOXH1: 144 473 412–144 475 873, pöördne ahelPPP1R16A: 144 475 989–144 502 126, otsene ahelGPT: 144 502 608–144 507 494, otsene ahelGPTSLC33A2: 144 508 263–144 511 317, otsene ahelSLC33A2RECQL4: 144 511 284–144 517 890, pöördne ahelRECQL4LRRC14: 144 517 957–144 526 244, otsene ahelLRRC24: 144 522 385–144 527 608, pöördne ahelC8orf82: 144 525 733–144 529 132, pöördne ahelARHGAP39: 144 529 179–144 685 879, pöördne ahelZNF251: 144 720 515–144 756 417, pöördne ahelZNF251ZNF34: 144 770 441–144 788 684, pöördne ahelZNF34RPL8: 144 789 765–144 793 502, pöördne ahelRPL8ZNF517: 144 798 863–144 813 034, otsene ahelZNF517ZNF7: 144 826 894–144 848 546, otsene ahelZNF7COMMD5: 144 837 760–144 854 229, pöördne ahelCOMMD5ZNF250: 144 876 497–144 902 217, pöördne ahelZNF250CPSF1 skeem: 38 eksonit kromosoomi 8 pöördne ahelalEkson 21: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 13: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 38: 144 393 231–144 393 365, 135 alustEkson 37: 144 393 452–144 393 590, 139 alustEkson 36: 144 393 667–144 393 796, 130 alustEkson 35: 144 393 883–144 394 038, 156 alustEkson 34: 144 394 113–144 394 160, 48 alustEkson 33: 144 394 234–144 394 300, 67 alustEkson 32: 144 394 379–144 394 555, 177 alustEkson 31: 144 394 644–144 394 796, 153 alustEkson 30: 144 394 882–144 395 023, 142 alustEkson 29: 144 395 098–144 395 182, 85 alustEkson 28: 144 395 265–144 395 355, 91 alustEkson 27: 144 395 435–144 395 551, 117 alustEkson 26: 144 396 348–144 396 500, 153 alustEkson 25: 144 396 598–144 396 741, 144 alustEkson 24: 144 396 840–144 396 929, 90 alustEkson 23: 144 397 207–144 397 413, 207 alustEkson 22: 144 397 487–144 397 661, 175 alustEkson 21: 144 397 743–144 397 879, 137 alustEkson 20: 144 397 954–144 398 132, 179 alustEkson 19: 144 398 302–144 398 443, 142 alustEkson 18: 144 398 525–144 398 638, 114 alustEkson 17: 144 398 779–144 398 868, 90 alustEkson 16: 144 398 958–144 399 038, 81 alustEkson 15: 144 399 128–144 399 202, 75 alustEkson 14: 144 399 276–144 399 373, 98 alustEkson 13: 144 399 452–144 399 503, 52 alustEkson 12: 144 399 588–144 399 710, 123 alustEkson 11: 144 399 781–144 399 868, 88 alustEkson 10: 144 399 992–144 400 085, 94 alustEkson 9: 144 400 166–144 400 276, 111 alustEkson 8: 144 400 354–144 400 493, 140 alustEkson 7: 144 400 671–144 400 817, 147 alustEkson 6: 144 400 924–144 401 075, 152 alustEkson 5: 144 401 211–144 401 291, 81 alustEkson 4: 144 401 430–144 401 563, 134 alustEkson 3: 144 401 646–144 401 673, 28 alustEkson 2: 144 409 015–144 409 172, 158 alustEkson 1: 144 409 289–144 409 335, 47 alust38353025201510515′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 4,5 kb kogupikkusega 16,1 kb; neist 4332 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse CPSF1

3

kohad geenis CPSF1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni CPSF1 16,1 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (4,5 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). CPSF1 geen: cleavage and polyadenylation specific factor 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/cpsf1

Vancouver

Dante Labs. CPSF1 geen: cleavage and polyadenylation specific factor 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/cpsf1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test