Gen
TIMM17B
translocase of inner mitochondrial membrane 17B
- HGNC 17310↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000126768↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 10245↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- Xp11.23
- Coordenadas
- Cromosoma X: 48.893.449–48.897.768 (GRCh38)
- Exones
- 6 exones en 4,3 kb
- Proteína
- 172 aminoácidos
- También conocido como
- DXS9822, JM3
- Transcrito MANE Select
- ENST00000696123.1NM_001395498.1
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muy alta
- Alta
- Baja
- Muy baja
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Estructura de TIMM17B
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 0,8 kb de los 4,3 kb del gen; 519 de esas bases codifican la proteína.
Secuenciación de TIMM17B
2Fácil
Lo difícil que es secuenciar TIMM17B con lecturas cortas, sobre 100
0 · Fácil100 · Difícil
Casi todos los exones de TIMM17B se encuentran en zonas donde las lecturas cortas se alinean sin problemas.
Lo que suma: la proporción de los exones de TIMM17B en cada tipo de región difícil
- MapeabilidadTramos en los que las lecturas de 100 o 250 pb no pueden ubicarse de forma única, por lo que una llamada allí puede faltar o ser errónea. Peso 100 %.0 %
- HomologíaDuplicaciones segmentarias: copias en otras partes del genoma, como parálogos y pseudogenes, con una identidad del 90 % o más. Peso 60 %.0 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Peso 60 %.0 %
- Cobertura de referenciaHuecos cercanos en el ensamblaje de referencia, donde no hay secuencia con la que las lecturas puedan alinearse. Peso 50 %.0 %
- RepeticionesRepeticiones en tándem y tramos de una sola base, en los que las lecturas se deslizan y que puede que no abarquen. Peso 30 %.2,1 %
- Contenido GCVentanas con menos del 25 % o más del 65 % de G y C, que la preparación de la biblioteca cubre de forma deficiente. Peso 20 %.5,5 %
Una puntuación de Dante Labs basada en nuestra propia investigación, construida sobre los mapas de regiones difíciles de secuenciar Genome in a Bottle, del NIST.Cómo se puntúaCada barra es la proporción de las bases de los exones de TIMM17B que se encuentran en ese tipo de región difícil. Cualquier tipo por sí solo puede hacer difícil un gen, y cada tipo adicional suma menos: 0 cuando ninguna base está en ninguno, 100 cuando todas las bases están donde las lecturas no pueden ubicarse de forma única.
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
De dónde procede
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- Las estratificaciones del genoma de Genome in a Bottle, del NIST: la puntuación de dificultad de secuenciación.
Citar esta página
Dante Labs. (s. f.). Gen TIMM17B: translocase of inner mitochondrial membrane 17B. Consultado el 19 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/timm17b
Dante Labs. Gen TIMM17B: translocase of inner mitochondrial membrane 17B [Internet]. [citado 19 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/timm17b
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