Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA
Zosekvenujte si svůj genom (otevře se na nové kartě)

Gen

MALAT1

metastasis associated lung adenocarcinoma transcript 1

Shrnutí

Cytogenetická poloha
11q13.1
Souřadnice
Chromozom 11: 65 499 045–65 506 516 (GRCh38)
Exony
1 exon na 7,5 kb
Další názvy
miPEP-52, PRO1073, MALAT-1, NCRNA00047, HCN, NEAT2, LINC00047, mascRNA
Transkript MANE Select
ENST00000850956.1NR_002819.5
Typ lokusu
Dlouhá nekódující RNA (lncRNA)

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen MALAT1. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je MALAT1 uspořádán

  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
Chromozom 11, se závorkou u MALAT1. MALAT1 a 51 genů poblíž na chromozomu 11, od 65 002 781 do 66 002 780.Chromozom 1111q13.1p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2565,2 Mb65,4 Mb65,6 Mb65,8 Mb66 MbARL2: 65 013 735–65 024 328, řetězec dopřednémARL2-SNX15: 65 014 182–65 040 570, řetězec dopřednémARL2-SNX15SNX15: 65 027 404–65 040 578, řetězec dopřednémSNX15SAC3D1: 65 040 897–65 047 320, řetězec dopřednémSAC3D1NAALADL1: 65 044 818–65 058 558, řetězec zpětnémNAALADL1CDCA5: 65 066 299–65 084 164, řetězec zpětnémZFPL1: 65 084 210–65 088 409, řetězec dopřednémCATSPERH: 65 084 974–65 089 375, řetězec zpětnémVPS51: 65 089 324–65 111 862, řetězec dopřednémTM7SF2: 65 111 845–65 116 677, řetězec dopřednémZNHIT2: 65 116 403–65 117 701, řetězec zpětnémZNHIT2FAU: 65 120 182–65 122 221, řetězec zpětnémFAUSYVN1: 65 121 780–65 146 912, řetězec zpětnémSYVN1MRPL49: 65 122 183–65 127 371, řetězec dopřednémMRPL49SPDYC: 65 166 137–65 173 380, řetězec dopřednémSPDYCCAPN1: 65 180 566–65 212 006, řetězec dopřednémCAPN1POLA2: 65 261 835–65 305 959, řetězec dopřednémPOLA2: 65 261 928–65 326 543, řetězec dopřednémCDC42EP2: 65 298 955–65 322 662, řetězec dopřednémCDC42EP2DPF2: 65 333 792–65 354 262, řetězec dopřednémDPF2TIGD3: 65 354 746–65 357 613, řetězec dopřednémTIGD3SLC25A45: 65 375 186–65 384 550, řetězec zpětnémSLC25A45FRMD8: 65 386 592–65 413 526, řetězec dopřednémFRMD8MALAT1: 65 499 045–65 506 516, řetězec dopřednémMALAT1SCYL1: 65 525 044–65 538 711, řetězec dopřednémSCYL1LTBP3: 65 538 556–65 558 930, řetězec zpětnémLTBP3ZNRD2: 65 570 459–65 574 203, řetězec dopřednémZNRD2FAM89B: 65 572 349–65 574 199, řetězec dopřednémFAM89BEHBP1L1: 65 575 943–65 594 089, řetězec dopřednémKCNK7: 65 592 836–65 595 996, řetězec zpětnémMAP3K11: 65 597 149–65 615 382, řetězec zpětnémPCNX3: 65 615 742–65 637 441, řetězec dopřednémPCNX3SIPA1: 65 638 086–65 650 930, řetězec dopřednémSIPA1RELA: 65 653 599–65 663 138, řetězec zpětnémRELAKAT5: 65 711 992–65 719 604, řetězec dopřednémKAT5RNASEH2C: 65 713 901–65 720 988, řetězec zpětnémRNASEH2CAP5B1: 65 772 723–65 781 708, řetězec zpětnémAP5B1OVOL1: 65 786 714–65 797 219, řetězec dopřednémOVOL1CFL1: 65 823 022–65 862 026, řetězec zpětnémCFL1SNX32: 65 833 664–65 856 896, řetězec dopřednémSNX32MUS81: 65 857 126–65 867 653, řetězec dopřednémMUS81EFEMP2: 65 866 300–65 878 497, řetězec zpětnémEFEMP2CTSW: 65 879 809–65 883 741, řetězec dopřednémFIBP: 65 883 740–65 888 532, řetězec zpětnémCCDC85B: 65 890 673–65 891 635, řetězec dopřednémFOSL1: 65 892 049–65 900 573, řetězec zpětnémC11orf68: 65 916 810–65 919 137, řetězec zpětnémDRAP1: 65 919 258–65 921 565, řetězec dopřednémDRAP1TSGA10IP: 65 945 480–65 960 217, řetězec dopřednémTSGA10IPSART1: 65 961 681–65 980 137, řetězec dopřednémSART1EIF1AD: 65 992 009–66 002 472, řetězec zpětnémEIF1ADBANF1: 66 001 832–66 004 170, řetězec dopřednémBANF1Schéma MALAT1: jeden exon na dopředném řetězci chromozomu 11Exon 1: 65 499 045–65 506 516, 7 472 bází15′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 7,5 kb z 7,5 kb genu.

Sekvenování MALAT1

1Snadné

Jak obtížně se MALAT1 sekvenuje krátkými čteními, ze 100

Téměř všechny exony genu MALAT1 leží v místech, kde se krátká čtení mapují čistě.

Co k tomu přispívá: podíl exonů genu MALAT1 v každém typu obtížné oblasti

  • Mapovatelnost0 %
  • Homologie0 %
  • Repetice6,4 %
  • Obsah GC3,1 %
  • Referenční pokrytí0 %

Skóre Dante Labs z vlastního výzkumu, založené na mapách obtížně sekvenovatelných oblastí Genome in a Bottle od NIST.Jak se skóre počítá

Externí odkazy

Odkud to pochází

  • HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen MALAT1: metastasis associated lung adenocarcinoma transcript 1. Staženo 18. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/malat1

Vancouver

Dante Labs. Gen MALAT1: metastasis associated lung adenocarcinoma transcript 1 [Internet]. [citováno 18. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/malat1

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test